Diapositive 1

1
(No Transcript)
2
(No Transcript)
3

• Barcoding
• Détermination de la frontière génétique
• Méthode 1 séquence, 40 espèces, 222 spécimens
• Résultats et analyse Il existe une différence
  marquée entre les variations intra et
  interspécifiques

4

• Barcoding
• Barcoding et phylogénie
• Peut-on utiliser une séquence appartenant à un
  spécimen donné pour construire les liens de
  parenté entre des taxons ?
• La réalisation de phylogénies avec des séquences
  de spécimens variés permet de valider
  lutilisation dune séquence de référence pour un
  taxon donnée.

5

• Barcoding
• Barcoding et expertise taxonomique un saucisson
   pur âne 

6
Approche cladiste des données moléculaires

• Alignement des séquences et repérage des sites
  informatifs

7
Approche cladiste des données moléculaires

• On adopte la même méthodologie quavec les
  caractères anatomiques. Chaque site informatif
  représente un caractère. Les états du caractère
  sont les différents acides aminés présents au
  niveau de ce site. Létat du caractère est
  déterminé par lacide aminé présent dans
  lextragroupe.

8
Approche cladiste des données moléculaires

• On obtient des arbres phylogénétiques différents
  en fonction de lordre dans lequel on prend les
  sites informatifs . Le choix de larbre le plus
  probable est déterminé par le principe de
  parcimonie.

9
Approche cladiste des données moléculaires

• Il existe des outils qui permettent de
  visualiser des arbres dont la construction sest
  faite par la méthode de parcimonie.

10
Approche cladiste des données moléculaires

• MEGA4 est un logiciel gratuit permettent des
  traitements multiples des données moléculaires.

Matrice de distance
Arbre UPGMA
Arbres parcimonieux
Alignement De séquences