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Nessun titolo diapositiva

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Title: Nessun titolo diapositiva Author: A.M.M.U. Last modified by: Carla Jodice Created Date: 11/25/2002 10:34:43 PM Document presentation format – PowerPoint PPT presentation

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Title: Nessun titolo diapositiva


1
STATISTICA F DI WRIGHT
Suddivisione della popolazione
? eccesso di omozigosità
I ? organismi individuali
Popolazione complessa è composta da
S ? sottopopolazioni
T ? popolazione totale
2
STATISTICA F DI WRIGHT
Si definiscono
HI eterozigosità media osservata tra le
popolazioni
Hs eterozigosità attesa della sottopopolazione
secondo la legge di Hardy-Weinberg
HT eterozigosità attesa di una popolazione
complessiva con accoppiamento casuale
3
STATISTICA F DI WRIGHT
HI eterozigosità media osservata tra le
popolazioni
Dato Hi come eterozigosità della popolazione i,
in caso di k popolazioni
4
STATISTICA F DI WRIGHT
Hs eterozigosità attesa della sottopopolazione
secondo la legge di Hardy-Weinberg
Dato pi,s come frequenza dellallele i-esimo
della sottopopolazione s, e Hs come eterozigosità
attesa della sottopopolazione secondo la legge di
Hardy-Weinberg, allora
5
STATISTICA F DI WRIGHT
HT eterozigosità attesa di una popolazione
complessiva con accoppiamento casuale
6
STATISTICA F DI WRIGHT
Con questi indici possiamo misurare
1) il coefficiente di consanguineità dovuto agli
accoppiamenti non casuali allinterno della
popolazione, mediante laumento dellomozigosità
FIS ? coefficiente di consanguineità
7
STATISTICA F DI WRIGHT
2) lindice di fissazione, che rappresenta la
perdita di eterozigosità di una popolazione
suddivisa dovuta alla deriva genetica
FST ? indice di fissazione
notare
perchè
Se la popolazione totale è in equilibrio di
Hardy-Weinberg
8
STATISTICA F DI WRIGHT
2pq
HT
HSB
Eterozigosità (H)
HSA
pA
pB
Frequenza allelica (p)
9
STATISTICA F DI WRIGHT
Per misurare il coefficiente di consanguineità
complessivo si può usare il parametro FIT che
comprende sia la perdita di eterozigosità dovuta
agli accoppiamenti non casuali allinterno della
sottopopolazione (FIS) sia la frammentazione
della popolazione complessiva (FST)
10
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
GOT Glutamic-Oxaloacetic Transaminase
Sono state individuate nel Texas 43
sottopolazioni di Phlox cuspidata. Queste
sottopopolazioni sono state studiate per quanto
riguarda il gene Got-2 che possiede 3 alleli
Got-2A, Got-2B e Got-2C.
I risultati sono stati
39 sottopopolazioni monomorfiche per Got-2B
1 con frequenze Got-2A
0,37 e Got-2B 0,63
1 con frequenze Got-2B
0,87 e Got-2C 0,13
1 con frequenze Got-2B
0,82 e Got-2C 0,18
1 con frequenze Got-2B
0,91 e Got-2C 0,09
11
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
frequenze n.
stpopol. Got-2A Got-2B Got-2C H oss H
att 39 - 1,00 - 1 0,37 0,63
- 1 - 0,87 0,13 1 - 0,82
0,18 1 - 0,91 0,09
0,00 0,17 0,09 0,09 0,06
12
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
13
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
frequenze n.
stpopol. Got-2A Got-2B Got-2C H oss H
att 39 - 1,00 - 1 0,37 0,63
- 1 - 0,87 0,13 1 - 0,82
0,18 1 - 0,91 0,09
0,00 0,17 0,09 0,09 0,06
0,00 0,47 0,23 0,30 0,16
14
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
e
15
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
frequenze n.
stpopol. Got-2A Got-2B Got-2C H oss H
att 39 - 1,00 - 1 0,37 0,63
- 1 - 0,87 0,13 1 - 0,82
0,18 1 - 0,91 0,09
0,00 0,17 0,09 0,09 0,06
0,00 0,47 0,23 0,30 0,16
43
16
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
17
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
18
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
frequenze n.
stpopol. Got-2A Got-2B Got-2C H oss H
att 39 - 1,00 - 1 0,37 0,63
- 1 - 0,87 0,13 1 - 0,82
0,18 1 - 0,91 0,09
0,00 0,17 0,09 0,09 0,06
0,00 0,47 0,23 0,30 0,16
0,00 0,47 0,23 0,30 0,16
43
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STATISTICA F DI WRIGHT esempio
HI eterozigosità media osservata tra le
popolazioni
Che è uguale alleterozigosità attesa media di
tutte le sottopopolazioni
20
STATISTICA F DI WRIGHT esempio
Coefficiente di consanguineità
è naturalmente uguale a zero
Indice di fissazione
Coefficiente di consanguineità complessivo
NOTA lindice di fissazione e il coefficiente di
consanguineità complessivo sono uguali
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