L

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Lutilisation des informations du pedigree pour
gérer la variabilité génétique dune population
en danger Lélevage du mouton Xalda en Asturies
en est un exemple.

• Travail de Génétique

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Introduction

• Lélevage de Xalda
• - en danger de disparition
• - Coefficient de consanguinité élevé
• ? Que faire pour la sauvegarde de lespèce?

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Introduction

• Le paramètre F
• - mesure de lidentité entre allèles
• - probabilité dobtenir des gènes
  identiques ()
• ? mesure le taux de pertes de
  variabilité génétique

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Introduction

• Taille de la population
• ? Influence très fort la variabilité
  génétique (fixation des gènes)
• ? Choix de reproducteur limités ? gènes ne
  sont plus tirés au sort ? dérive génétique dans
  un sens.

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Introduction

• Pour maintenir la variabilité il est nécessaire
  de monitorer en utilisant un ens. de paramètres
  caractérisant
• - structures de la population
• - pratique de gestion
• Les xaldas est un exemple représentatif au niveau
  des études pour la conservation de la génétique
  animale developpée en Europe

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Matériel

• - Analyse de linformation des pedigree de
  lassociation des éleveurs de moutons Xalda (
  ACOXA) de 1992 à 2001.
• - 9 lignées
• - 805 moutons enregistrés
• - 562 vivants dont 507 femelles
• - Population très jeune

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• - Ne Nombre efficace en fonction du
  nombre de mâles et de femelles utilisés.
• Ne 4(NmNf)/(NmNf)

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• - Le paramètre F
• ? mesure de lidentité entre allèles
• ? probabilité dobtenir des gènes
  identiques ()
• ? mesure le taux de pertes de
  variabilité génétique

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• - Le paramètre F
• DF 1/(2Ne)

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• -AR
• ? Coefficient moyen de
  non-relation
• ? Indique la contribution
  génétique à la population

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• -AR Utilisées comme
• ? index pour maintenir le stock
  génétique initial
• ? comparer la consanguinité au
  sein dune sous population

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Méthodes

• Différents paramètres utilisés
• -AR Calcul du coefficient pour un
  fondateur
• 1? Pour le fondateur (car il
  appartient à la population)
• 1/2? Par fils du fondateur (dans
  la population)
• 1/4? Par petit fils du fondateur
  (dans la population)

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Résultats et discussion

• Utilisation abusive de certains individus
• gt ? de la variabilité génétique
• Nombre très faible dancêtre ? race rencontre un
  d de selection de la part des éleveurs qui
  utilisent massivement un nombre réduit de
  reproducteur (choisit sur la conformation)

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Résultats et discussion

• Intervalle de génération moyen réduit
  3 ans
• - voie père-fils courte (relève)
• - voie mère-filles longue
  (attente de voir ses résultats)
• 13 ancêtres ? 50 de la variabilité génétique

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Résultats et discussion

• La moyenne des F de la population 1,762
  (faible)
• Mauvaise estimation il ny a que 7
  générations, pedigree top court
• Ne sera donc mal estimé de part la formule
  
• F nest donc pas un bon indicateur de perte de
  gènes.

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Résultats et discussion

• AR peut-être utilisé comme complément pour
  estimer la consanguinité dans une population
• - évalue la contribution
  génétique des fondateurs
• - évalue la représentation
  génétique de chaque individu qui nest pas
  fondateur

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Résultats et discussion

• AR est utilisé indirectement pour caractériser
  les troupeaux comme représentation de la
  population

18
Résultats et discussion
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Conclusions

• Manque dinfos sur la taille de la pop ?
  sous estimation nb dindividus consanguins mais
  hauts coef. dinbreeding ? pas possible
  dutiliser les paramètres habituels
• ? utilisation de nouveaux paramètres
• Usage abusif de certains individus aux dépends
  dautres

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Conclusions

• Utilisation de lAR
• Infos sur la description de la pop. et du
  management
• Plus facile à calculer et à comprendre par les
  éleveurs

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Conclusions

• En pratique
• Calcul de lAR pour chaque individu après la
  saison des naissances
• Favoriser certains accouplements
• Égaliser la représentation génétique des
  différentes lignées et troupeaux

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Conclusions

• Sélection des béliers ayant lAR le plus bas
  possible
• Sélection des mères à béliers sur leur
  conformation parmi les moins représentées
  génétiquement

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Bibliographie

• GOYACHE F., GUTTIERREZ J.P., FERNANDEZ I., GOMEZ
  E., ALVAREZ I., DIEZ J., ROYO L.J., Using
  pedigree to monitor genetic variability of
  endangered populations the Xalda sheep breed of
  Asturias as an example, J. Anim. Breed. Genet.,
  120 95-105 (2002)

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