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UIC I G

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UIC I G n tique - Cours 2 GENETIQUE HUMAINE LE PRINCIPE DE LA TECHNIQUE FISH La technique FISH Sonde et ADN cible Le marquage de la sonde indirect et direct La ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: UIC I G


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UIC IGénétique - Cours 2GENETIQUE HUMAINE
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LEUCHROMATINE ET lHETEROCHROMATINE
  • la CHROMATINE ADN proteines
  • Exclusive dans noyau
  • 2 types morpho-fonctionelles
  • EUCHROMATINE
  • active genetique
  • dispersee
  • HETEROCHROMATINE
  • inactive genetique
  • condensee
  • (chromocentres)

Caracteristiques EUCHROMATINE HETEROCHROMATINE
Condensation Dispersee condensee (chromocentres)
Coloration Faible Intense
Le temps de la replication (la phazs S) Precoce Tardive
Activite genetique Active Inactive (ou faible)
Composition chimique Predomine p.b. C - G ADN nerepetitif des proteines nonhistoniques Predomine p.b. A - T ADN repetitif des proteines histoniques
Role morphologique Constitue des bandes R positives (ou G negatives) Constitue les bandes R negatives (ou G positives)
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LEUCHROMATINE ET LHETEROCHROMATINE
  • LHETEROCHROMATINE
  • Constitutive presence constante en structure du
    chromosomes
  • les bandes G, bandes C (cen, Yq, p A, CS)
  • facultative different en cellulee /
    organismes differents
  • (lhetrochromatinisation une forme de reglage
    genique) ex., la chromatine sexuelle

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LA CHROMATINE SEXUELLE
  • La CHROMATINE SEXUELLE
  • un chromocentre de HCRT
  • avec caracteristiques morphologiques precises,
  • permets lidentification le numero des
    chromosomes sexuells
  • - lidentification de sexe genetique (XX sau
    XY)
  • - les anomalies des chromosomes sexuells
  • (XO, XXX, XXY).
  • A la femme la chromatine X (le corpuscul du
    Barr)
  • Aux males la chromatine Y (le corpuscul F)

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LORIGINE DE LA CHROMATINE SEXUELLE
  • La chromatine X
  • resulte par linactivation dun chromosome X (a
    la femme XX)
  • ? le corpuscul du Barr
  • Lhypotese Lyon (1961)
  • 1- linactivation du chromosome X est total a
    chaque sexe
  • ? un seul chromosome X activ.
  • (correct partiel ?ils sont des genes actives
    sur les 2 chromosomes X)
  • 2- se produit precoce (in utero) et est
    definitive (parfois reversibile)
  • 3- se produit par hasard (XM ou XP) et
    independents en chaque cellule (parfois correle
    avec la structure de chromosome X)

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Numero des c. Barr la somme des
chromosomes X inactives(numero des chromosomes X
nr. c. Barr 1)
DIAGNOSTIQUE Femme Femme Femme Homme Homme Homme
Nr. C. Barr 0 1 2 0 1 2
Sexe genetique (dans intersexualite) XX XY
Des snomalies de numero des chromosomes sexuelles (des dysgenesies gonadiques XO XXX XXY XXYY XXXY
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LA CHROMATINE SEXUELLE
  • LA CHROMATINE Y
  • represent lheterochromatine de 2/3 parts
    distales de bras long
  • de chromosome Y
  • (se colore avec flurochromes ex., quinacrine
    et est visible
  • a la microscope avec UV comme un corpuscul
    fluorescent -
  • corpuscul F)
  • exclusive aux hommes
  • Nr. corpuscule F nr. cromosomes Y
  • les hommes XYY ont 2 corpuscules F

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LA STRUCTURE SUPRAMOLECULAIRE DE LA CHROMATINE
  • Lanalyse de la chromatine a la microscope
    electronique a indique un systeme complex de
    compactage de la molecule de lADN
  • ? des fibres de chromatine
  • avec dimensions differentes
  • Formees par ADN, histones et proteines
    nonhistoniques.

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Le nucléosome (10nm)
U.M.F IASI
  • Un segement dADN (146pb)
  • Spirale 1 tour ¾
  • autour dun  noyau  histonique, cylindrique
    (8molec)
  • ? un NUCLEOSOME
  • Les nucléosomes voisins ? liés par un segment
    dADN lineaire (60pb) ? le FILAMENT avec
    NUCLEOSOMES (collier des perles").
  • Le filament avec nucleosomes est stabilise par
    la histone H1, qui lie deux nucleosome voisins.
  • Un taux de "compactage" 101

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2) Le solenoide (30nm)
  • Le filament avec nucleosomes se spirale en
    solenoide (30 nm)
  • Taux de "compactage" de filament avec nucleosomes
    51

3) La fibre de chromatine pliee en boucles
laterales (300 nm)
  • Le solenoide (30 nm) se plie en boucles
    laterales atachees au squelette des proteines
    nonhistoniques ? 300nm
  • Une boucle (un domain chrs) 75Kb quelque
    genes
  • unite fonctionel (de transcription et de
    replication).
  • Taux de "compactage" 101

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Le chromosome metaphasique (300 nm)
  • En prophase les fibres de chromatine se
    condensent (201) ? la chromatide (700 nm) dun
    chromosome
  • Les chromosomes grade maximal de condensation
    en metaphase de la division

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U.M.F IASI
  • ADN ? Nucleosome ? solenoide ? la fibre de
    ? LA CHROMATIDE
  • CHROMATINE ? DUN
  • PLIEE EN BOUCLES CHROMOSOME
  • INTERPHASE
    DIVISION
  • Chaque chromatide a une seule molecule dADN
  • organisee en plusieurs structures succesives,
  • compactee 10.000 fois necessaire pour
  • Le placement ordone des molecules de lADN en
    noyau
  • La distribution correcte du materiaux genetique
    en division

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  • Les boucles de la fibre de chromatine se fixent
    irreguliere aux squelette proteique
  • Des zones condensees les chromomeres
  • Des zones moins compactes
  • Par la condensation de la chromatide en
    prophase,
  • les chromomeres sunissent et formente des
    bandes condensees et colorees (bandes G
    lheterochromatine)
  • qui alternent avec des bandes moins condensees
    et colorees
  • (bandes R leuchromatine).

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U.M.F IASI
  • Chaque chromosome a une structure interne
  • heterogene
  • caracteristique
  • (qui permets lidentification precise)

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LES CHROMOSOMES
  • CHROMOSOMES organites nucleaires qui fixent des
    colorants basiques
  • (gr. chroma couleur soma corp)
  • Fonctions
  • Le transport distribution du materiel genetique
    en division ? la stabilite des procesus
    hereditaires.
  • Assurent la recombinaison genetique en meiose

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La morphologie des chromosomes humainsdes
elements communs a tous chromosomes
U.M.F IASI
  • 1- Les CHROMATIDES
  • - Crs bichromatidien ? apres la replication
  • Les chromatides dun chromosome sont identiques
    (soeurs) 1 molecule dADN Proteines
  • 2- Le CENTROMERE
  • Le lieu de attachement des chromatides soeurs
    (par la proteine ISS)
  • unique ? constriction primaire
  • Divise les chromatides en 2 bras p et q
  • A une position fixe determinee par une sequence
    dADN repetitif (ADN satellite) identique a tous
    les chromosomes) ADN specifique a chaque
    chromosome
  • Des chromosomes
  • Metacentrique,
  • Submetacentrique
  • Acrocentrique

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Elements communs a tous chromosomes
  • 2- Le CENTROMERE
  • Role essentiel pour la SEGREGATION des
    chromosomes pendant la division cellulaire
  • A lADN centromerique se fixent des proteines
    CENP kinetochores ? lieu datachement aux
    filaments de fuseau mitotique ? qui tractent les
    chromatides vers les poles (en anaphase)

M
T
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Elements communs a tous chromosomes
  • 3- Les TELOMERES des structures specialisees,
    formees par ADN repetitif proteines, qui
    couvrent et protegent les extremites des
    chromosomes.
  • Fonctions
  • Maintiennent l integrite structurelle
  • Assurent la replication complete
  • positionnent les chromosomes dans le noyau

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Elements particuliers des chromosomes
U.M.F IASI
  • Les SATELLITES des formations
    dheterochromatine attaches aux bras courts des
    chromosomes acrocentriques (excepté Y) des
    variantes normales
  • (2) Des CONSTRICTION SECONDAIRES des blocs
    dheterochromatine situes sur quelques
    chromosomes (1q, 9q, 16q) pres de centromere
    variantes normales
  • (3) Des SITES FRAGILES des lacunes moins
    colorees sur les chromatides des quelques
    chromosomes. La majorite variantes normales
    lexception fra Xq27 associe avec une forme de
    retard mentale
  • Sdr. X fragile (RMLX-14000 nn)

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Elements specifique a chaque chromosome les
BANDES
  • Utilisant different traitements chimiques nous
    obtenons une serie continue de bandes
    longitudinales colorees qui alternent avec des
    bandes moins colorees
  • Les bandes refletent la structure heterogene des
    chromosomes
  • Chaque chomosome a un model caracteristique de
    bandes
  • ? lidentification precise.

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LES TECHNIQUES DANALYSE CHROMOSOMIQUE
  • a) Le principes des methodes
  • 1- Obtention de cellules en division
  • Des cultures cellulaires lymphocytes,
    fibroblastes, cellules foetales (? amniocentese)
  • - 0,5 ml du sang peripherique (recolte steril,
    sur heparine) ? milieu de culture avec
    phytohemaglutinine (stimule des divisions) ? 72
    heures
  • Des tissus qui se divisent activement moelle
    osseuse
  • (? ponction medullaire), trophoblaste (?
    placentocentese)
  • 2- Obtention de cellulee en metaphase bloque la
    division avec colchicine
  • 3- Obtention de preparations cellulaire
    hypotonisation, fixation, etalement sur lamelle,
    coloration techniques de marquage en bandes
  • 4- Lanalyse des preparation ? caryotype

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LES TECHNIQUES DANALYSE CHROMOSOMIQUE
  • LES TECHNIQUES DE GENERATION I (1956)
  • - des chromosomes uniformement colores
  • - identification imprecise
  • LES TECHNIQUES DE GENERATION II (1970)
  • - le marquage en bandes G ou R sur chromosomes
    metaphasiques (400 bandes)
  • - identification precise

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TECHNIQUES DANALYSE CHROMOSOMIQUE
  • DES TECHNIQUES DE GENERATION III (1977)
  • - techniques de haute resolution sur chromosomes
  • pro-métaphasiques (550 bandes) ou
  • prophasiques (850 bandes)
  • - une bande 3-5 Mb
  • DES TECHNIQUES DE GENERATION IV (1991)
  • - cytogenetique moleculaire
  • - FISH metaphasique
  • - identification tres precise des translocations
    chromosomiques et microdeletions
  • - FISH interphasique

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  • F fluorescence
  • I in
  • S situ
  • H hybridization

Hybridasation fluorescent in situ
Technique moleculaire pour detection des
anomalies chromosomiques
Technique moleculaire pour localisation des
sequences geniques
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LE PRINCIPE DE LA TECHNIQUE FISH
  • Hybridation (formation des liaisons de
    hydrogene) entre une sonde specifique dADN
    (marquee fluorescente) et la sequence
    complementaire presente dans un segment
    chromosomique
  • ? la lois de la complémentarité des bases
    nytrogenique
  • A-T
  • C-G

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La technique FISH
  • Sonde et ADN cible
  • Le marquage de la sonde indirect et direct
  • La dénaturation de la sonde et ADN cible
  • Lhybridation entre sonde et lADN cible
  • La fixation de fluorophore a lhaptène (marquage
    indirecte)

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Exemple de sondes
  • Sonde de lADN répétitif
  • b) Sonde centromerique (cellule interphasique)
  • c) Sondes telomeriques (cellule metaphasique)
  • a) Sondes specifiques de locus (preparation
    prometaphasique)
  • d) Sonde panchromosomique (preparation
    prometaphasique)

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LES AVANTAGES
  • DES SENSIBILITE ET SPECIFICITE GRANDES
  • LE TEMPS COURT DE LA METHODE
  • LA POSSIBILITE DANALYSE DES CELLULES EN DIVISION
    OU INTERPASE
  • LA RESOLUTION GRANDE (sondes jusquaux 40 kb)

LES INCONVENIENTS
  • LE COUT AUGMENTE DES SONDES ET REACTIVES
  • LE COUT AUGMENTE DES APPAREILS
  • LE DEGRE ELEVEE DE TECHNICITE
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