Institut Mditerranen d'Ecologie et de Palocologie UMR CNRS Universits dAixMarseille I et III Assembl

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Institut Méditerranéen d'Ecologieet de
Paléoécologie UMR CNRS / Universités
dAix-Marseille I et III Assembl
ée générale du 26/01/2004
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AG - 26 / 01 / 2004

• Rappels des grandes lignes du projet
• Retour des évaluations
• Evolutions et changements

IMEP Institut Méditerranéen d Ecologie et de
Paléoécologie UMR 6116
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PROJET 2004 - 2007
Présentation
Département I Ecologie historique et
changements globaux Département II
Organisation et dynamique de la
biodiversité Département III Processus
fonctionnels et adaptatifs Services
communs Biologie moléculaire SIG / Bases de
données Serres / Jardins Bibliothèque ?
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Institut Méditerranéen d'Ecologieet de
Paléoécologie (IMEP)UMR CNRS / Universités
dAix-Marseille I et III Projet 2004/2007

• Objectif général 
• étudier et comprendre comment les perturbations
  locales interagissent avec les forçages globaux
  pour structurer les écosystèmes méditerranéens et
  leur remarquable biodiversité
• 67 permanents (4819) 36 doctorants
• 4 ATER 2 CDD

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Projet IMEP - 2004 / 2007Restructuration en 3
départements

• Dpt 1  Ecologie historique et changements
  globaux
• Responsable Frédéric Guibal (CR CNRS)
• 13 permanents
• Dpt 2  Organisation et dynamique de la
  biodiversité
• Responsable Frédéric Médail (MC, U3)
• 22 permanents
• Dpt 3  Processus fonctionnels et adaptatifs 
• Responsable Anne-Marie Farnet (MC, U1)
• 27 permanents
• Services communs
• Bio. Mol., SIG/BD, Serres / Jardins, Bibliothèque
• Administration, gestion
• 3 permanents (2 ITA, 1 IATOS)

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Composition 2 équipes de recherche
• Palynologie et paléoentomologie
• Valérie Andrieu-Ponel
• 1 DR, 1 CR, 1 MCF, 1/2 ITA
• Macro-restes végétaux et dendroécologie
• Martin Lavoie
• 3 CR, 3 MCF, 2 IR, 1 IE, 1/2 ITA

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Thématique générale
• Etude de lhistoire de la biosphère
• par une approche rétrospective
• de létat passé des systèmes écologiques associée
  à la modélisation
• Enjeu important dans le cadre
• des changements globaux
• et de leffondrement du système agrosylvopastoral

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Modèles généraux
• - L intégration du passé, à différents degrés de
  résolution spatio-temporelle, est fondamentale
  pour la mise en place de modèles explicatifs de
  la biodiversité et de la dynamique actuelle
• - La validation des modèles de végétation ou des
  modèles climatiques repose sur
• - l utilisation des bases de données
• - le couplage avec des données  actuelles 
• - la pertinence des bioindicateurs

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Moyens  dinvestigation
• 5 niveaux dorganisation
• Régions, Paysages, Communautés, Populations,
  Individus
• Approche multi-échelles spatiale et temporelle
• Diversité des bioindicateurs
• Pollen, insectes, macro-restes végétaux, cernes
  annuels
• 1 milieu continental

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Principaux axes de recherche
• ? Reconstitutions climatiques à haute résolution
  temporelle et spatiale
• comparaison longues séquences continentales
  (IMEP), océaniques, polaires
• comparaison bioindicateurs (IMEP) et données
  isotopiques

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Principaux axes de recherche
• ? Impact des changements globaux
• validation de modèles climatiques
• validation de modèles de végétation
• importance des refuges et phylogéographie (D II)
• systèmes forestiers montagnards et
  méditerranéens
• croissance ligneuse et cycles C, H20 (D III)

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Principaux axes de recherche
• ? Dynamique de la végétation et anthropisation
• reconstitution des  paléo-paysages  (D II)
• impact spatial et temporel des perturbations (D
  III)
• conséquences sur les patrons de biodiversité (D
  II)

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Département I Ecologie historique et
changements globaux

• Principaux axes de recherche
• ? Améliorations méthodologiques et référentiels
• flux polliniques (D II)
• aspects taphonomiques
• collections de référence macro-restes

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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité  

• Composition 3 équipes de recherche
• Ecologie du paysage et biologie de la
  conservation
• Philip Roche 1 Pr., 7 MC, 1 CR
• Ecologie des eaux continentales méditerranéennes
• Arlette Cazaubon 1 Pr., 4 MC, 1 IATOS
• Biosystématique et écosystèmes méditerranéens
• Marcel Barbero 1 Pr., 1 MC, 1 DR, 2 CR, 1
  IATOS

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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Thématique générale Comprendre les facteurs
écologiques et évolutifs impliqués dans la
création et le maintien de la biodiversité au
sein des paysages méditerranéens
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité  
Modèles généraux - Impacts des perturbations
naturelles et anthropiques sur la composition et
la dynamique des populations et des
communautés - Organisation et particularités de
la composition et de la répartition des flores
et des faunes en région méditerranéenne
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité

• Moyens dinvestigation
• 3 niveaux spatiaux
• - populations, communautés, paysages
• 3 approches de la biodiversité
• - systématique, fonctionnelle, génétique
• 2 grands types de milieux
• - terrestre et eaux continentales

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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité

• Principaux axes de recherche
• ? Conséquences des changements dans les modes
  dusage des terres sur les patrons de
  biodiversité
• approche intégrée des relations
  perturbations-biodiversité depuis la communauté
  jusquau paysage
• ? organisation de la biodiversité au niveau du
  paysage
• analyse spatio-temporelle et patrons de
  végétation des
• agrosystèmes de moyenne-montagne
• ? écologie spatiale et fonctionnelle des
  interfaces ville/forêt
• ? dynamique de la végétation et maturation
  forestière
• ? rôle des incendies, histoire et dynamique des
  forêts sur silice
• Réseau européen  PAN European Thematic Network
• on Cultural Landscapes and their Ecosystems 

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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Principaux axes de recherche ? Réponses des
systèmes aquatiques face aux discontinuités ou
continuités spatiales et temporelles
variabilité des régimes de perturbation et des
réponses des organismes face aux
discontinuités ? modèle  rivières aménagées 
(bassin versant de la Durance) ? modèle
 milieux temporaires méditerranéens 
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Principaux axes de recherche ? Importance des
interactions biotiques en biologie de la
conservation et en écologie de la
restauration rôle dans les capacités de
résilience des communautés et dans les capacités
de maintien des espèces rares ou menacées ?
facteurs écologiques et évolutifs impliqués dans
les modalités de reproduction et de dispersion
des espèces ? interactions trophiques complexes
en situation insulaire ? processus de
compétition vs. facilitation des espèces
structurantes
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Principaux axes de recherche ? Biologie des
invasions et conservation de la
biodiversité approches écologique et génétique
des espèces envahissantes et surabondantes ?
modèles végétaux (Carpobrotus, Ludwigia,
Ambrosia?) ? modèles animaux (Xeropicta, Larus)
Programmes européen EPIDEMIE et national INVABIO
(3 programmes en cours)
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Principaux axes de recherche ? Conservation des
espèces rares ou endémiques aspects
démographiques, génétiques et écologiques ?
stratégies de survie des espèces rares (modèles
Gentiana, Leucojum...) ? capacités de maintien
des espèces rares face aux changements
environnementaux (modèles Puffinus, Genista
lobelii...) ? tendances démographiques à moyen
terme de divers groupes fonctionnels de végétaux
rares (sites-ateliers, aires protégées) Programme
européen LIFE sur la conservation des puffins de
Méditerranée
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Département II Organisation et dynamique de la
biodiversité
Principaux axes de recherche ? Phylogéographie
et importance des zones-refuges en région
méditerranéenne approches macroécologique,
génétique et cytotaxonomique ? identification
macro- et micro-régionale des zones-refuges ?
implications possibles dans le cadre du
 changement global  ? combiner divers
marqueurs biologiques ? approche
spatio-temporelle intégrée avec le département 1
et lINRA (B. Fady)
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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• Composition 3 équipes de recherche
• Ecologie fonctionnelle
• Gilles Bonin 1 Pr, 7 MC, 3 CR, 3 IATOS
• Ecologie microbienne
• Gabrielle Vogt 1 Pr, 4 MC, 2 IATOS, 1 ITA
• Génétique adaptative
• Serge Gudin 1 Pr, 2 MC, 1 DR, 1 IATOS, 1 ITA

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Thématique générale
Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• Fonctionnement des écosystèmes méditerranéens
• Perturbations environnementales
• ?naturelles
• ?anthropiques

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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• Moyens dinvestigation
• 3 niveaux spatiaux
• individus, populations, communautés
• Différents compartiments de lécosystème
• - végétation, sol et litière

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Principaux axes de recherche
Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• Cycles biogéochimiques (activités microbiennes)

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Impact des facteurs abiotiques sur les cycles
biogéochimiques
Végétaux distribution spatiale de la biomasse,
stock carboné, flux des nutriments
Température pH Humidité Pluviométrie Facteurs
édaphiques
Populations bactériennes et fongiques
Activités et isoformes enzymatiques
Phénoloxydases Cellulases / hémicellulases

• Autres écosystèmes méditerranéens Quercus suber
  L., Pinus sp...
• Simulations en microcosmes

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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs
Principaux axes de recherche

• 1. Cycles biogéochimiques (activités
  microbiennes)

• Métabolites secondaires dorigine végétale

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Facteurs abiotiques et biotiques Climat Couverture
végétale Facteurs édaphiques
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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• 1. Cycles biogéochimiques (activités
  microbiennes)
• Métabolites secondaires dorigine végétale

• 3. Biologie adaptative des végétaux dans divers
  écosystèmes

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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• Biodiversité liée à des environnements différents

chez le pin noir
chez le chêne vert
chez certains rosiers sauvages

• Génétique fonctionnelle

régulation génétique en fonction des conditions
environnementales (ex pression de salinité du
sol)
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Département III Processus fonctionnels et
adaptatifs

• 1. Cycles biogéochimiques (activités
  microbiennes)
• Métabolites secondaires dorigine végétale
• Biologie adaptative des végétaux dans divers
  écosystèmes

• 4. Effets des perturbations sur les processus
  fonctionnels, biodégradation de certains
  polluants

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Impact des activités anthropiques sur le
fonctionnement des écosystèmes
Perturbations anthropiques
Végétal Relations interspécifiques Réponses
écophysiologiques
Microflore Modification des biodiversités
bactériennes et fongiques
Mésofaune Modification de la biodiversité
Augmentation / Altération du pool enzymatique lié
à la dégradation de la matière organique
Biodégradation des composés polluants
Croissance-Bilans minéraux Production de
métabolites secondaires (bioindicateurs)
Bioindicateurs
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PROJET 2004 - 2007
Présentation
Département I Ecologie historique et
changements globaux Département II
Organisation et dynamique de la
biodiversité Département III Processus
fonctionnels et adaptatifs Services
communs Biologie moléculaire SIG / Bases de
données Serres / Jardins Bibliothèque ?
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Services communs Biologie moléculaire SIG /
Bases de données Serres / Jardins Bibliothèque
? Mettre en place des groupes de réflexion
autour dun animateur pour définir les contours
et établir les statuts de chaque service
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AG - 26 / 01 / 2004

• Rappels des grandes lignes du projet
• Retour des évaluations
• Evolutions et changements

IMEP Institut Méditerranéen d Ecologie et de
Paléoécologie UMR 6116
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Evaluations du projet
Rapport du Comité National  position originale
dans le paysage scientifique français  -
focalisation sur les écosystèmes
méditerranéens - prise en compte des activités
humaines  réorganisation globalement logique 
mais - faire évoluer les découpages par types
décosystèmes - transversalités à
développer Donc Avis favorable, mais - Cadre
théorique des recherches à mieux formaliser -
Visibilité internationale, publications
généralistes - Condition des ITA-IATOS
Autres avis
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AG - 26 / 01 / 2004

• Rappels des grandes lignes du projet
• Retour des évaluations
• Evolutions et changements

IMEP Institut Méditerranéen d Ecologie et de
Paléoécologie UMR 6116
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Projet IMEP - 2004 / 2007Des changements
structurels pour optimiser la recherche

• Une organisation plus fonctionnelle de lunité
• Identification claire du rôle des responsables
  aux différents niveaux de lorganigramme
• Régularité dans les cycles de réunion et
  officialisation des échanges
• Développement des services communs
• Amélioration des conditions de travail

• Proposition dun projet scientifique global
• Affirmer les trajectoires innovantes et/ou
  porteuses
• Assurer la convergence des thématiques en
  sappuyant sur lanimation scientifique et les
  problématiques transversales
• Développer les échanges scientifiques avec
  lextérieur autour du projet

• Forte implication dans lenseignement et la
  formation
• Projets de Mastères, formations continues,
  stages

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Projet IMEP - 2004 / 2007Problématiques
transversales

• Entre les départements 1 et 2
• A. Paléoécologie du paysage
• B. Approche phylogéographique
• Entre les départements 1 et 3
• C. Pin dAlep / pollutions de lair
• D. Contraintes écologiques et
• productivité des écosystèmes
• Entre les départements 2 et 3
• E. Activité de la rhizosphère et
• biodiversité floristique
• F. Processus allélopathiques chez
• les plantes envahissantes
• impact sur la biodiversité
• G. Dégradation de la matière
• organique et conséquences sur
• la biodiversité

Changement global et biodiversité
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Projet IMEP - 2004 / 2007Des changements
structurels pour optimiser la recherche

• Une organisation plus fonctionnelle de lunité
• Identification claire du rôle des responsables
  aux différents niveaux de lorganigramme
• Régularité dans les cycles de réunion et
  officialisation des échanges
• Développement des services communs
• Amélioration des conditions de travail

• Proposition dun projet scientifique global
• Affirmer les trajectoires innovantes et/ou
  porteuses
• Assurer la convergence des thématiques en
  sappuyant sur lanimation scientifique et les
  problématiques transversales
• Développer les échanges scientifiques avec
  lextérieur autour du projet

• Forte implication dans lenseignement et la
  formation
• Projets de Mastères, formations continues,
  stages

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Projet IMEP - 2004 / 2007Nouvelle organisation
fonctionnelle
Equipes
Cf. le règlement intérieur de lUnité pour les
détails sur le fonctionnement de chaque niveau,
les rôles des responsables et des animateurs
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AG - 26 / 01 / 2004

• Le règlement intérieur
• Organisation de lUnité
• Comité scientifique et Conseil de Laboratoire
• Fonctionnement de lUnité
• Départements, équipes, services communs
• Hygiène et sécurité
• Charte des stagiaires
• Mise en uvre de lARTT

IMEP Institut Méditerranéen d Ecologie et de
Paléoécologie UMR 6116
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Projet IMEP - 2004 / 2007Nouvelle organisation
fonctionnelle
Conseil de Laboratoire
Membre de droit - le directeur 5 Membres
nommés - dont les 3 responsables de
département 9 Représentants élus - 3
Enseignants-chercheurs - 2 Chercheurs, - 1
IATOS - 1 ITA - 2 Doctorants Membres invités
- 1 représentant de lAVIR (présentation de F.
Furodet) - 1 ACMO Hygiène et Sécurité
Mise en place dune commission électorale 5
membres (1 / collège)
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AG - 26 / 01 / 2004

• Budget U3 mise en place de JEYFICO
• Répartition des responsabilités
• Président, UFR (UB), Unités (CR), Chercheur (UC
  pour les R3)
• Au niveau de lIMEP Pour R1 et C 2 UC 143 et
  144
• Validation centralisée des commandes
• IMEP dotations annuelles antérieures
• CNRS 60 k (45 k en 2003)
• Université 70 k (fonctiont.) 10 à 20 k
  (équipt.)

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AG - 26 / 01 / 2004

• Les premiers  chantiers  planning (1,5 mois
  max)
• Appel à candidatures pour le Conseil de Labo.
• Organisation des élections
• Rédaction et adoption du règlement intérieur
• Consultations (Intranet) et
• Concertation (réunion des animateurs déquipe)
• Rédaction finale
• Groupes de réflexion  services communs 
• AG Approbation du Règlement intérieur,
  présentation du Conseil de Laboratoire,
  formalisation des Services communs

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AG - 26 / 01 / 2004

• Remarques diverses
• Gestion du multi-sites, locaux St-Jérôme (G.
  Bonin)
• Place des ITA-IATOS dans lunité
• Diriger ? commander
• La première mission du Conseil de Labo.
• Fonctions du  staff  administratif gestion
• Finances et gestion des personnels (congés,
  missions..)
• Information et communication
• Mise en place dun certain formalisme mais

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AG - 26 / 01 / 2004

• En vous remerciant de votre attention
• Les questions ?

IMEP Institut Méditerranéen d Ecologie et de
Paléoécologie UMR 6116