Modles et Algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations - PowerPoint PPT Presentation

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Modles et Algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations

Description:

G nomique comparative, Analyse de donn es biologiques, Mod lisation ... un graphe cible en appliquant diff rentes op rations structurelles l mentaires ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: Modles et Algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations


1
Modèles et Algorithmes pour la Bioinformatique et
la Visualisation d'informations
  • Guy Melançon
  • Pascal Ferraro
  • David Auber
  • David Sherman

2
Génomique comparative, Analyse de données
biologiques, Modélisation
  • génomique comparative, Modélisation, Analyse de
    données biologiques
  • algorithmique pour l'analyse de structures
    biologiques
  • visualisation de grandes masses de données

David Sherman
3
Modèles Algorithmes BioinformatiqueVisualisation
d'informations
4
Génomique comparative, Analyse de données
biologiques, Modélisation
  • répertorier les composants codés par les génomes
  • identifier comment ils travaillent pour assurer
    les fonctions cellulaires
  • comprendre comment les génomes changent et
    acquièrent des nouvelles fonctions

David Sherman
5
Génomique comparative, Analyse de données
biologiques, Modélisation
6
Génomique comparative, Analyse de données
biologiques, Modélisation
7
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • étude dobjets biologiques arborescents
    (structures secondaires d'ARNs, architecture de
    plantes, etc.)?
  • reconstruire un graphe cible en appliquant
    différentes opérations structurelles élémentaires

Pascal Ferraro
8
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • description / comparaison de structures dARN

Bacillus subtilis
Homo sapiens
9
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • description dune structure dARN
  • comparaison (édition) darbres / calcul de
    similarités

10
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • description dune structure dARN
  • approche multi-échelles

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Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • auto-similarité des structures arborescentes
    (chez les plantes)?
  • arbres multi-échelles
  • invariants par transformations/réécritures

12
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • auto-similarité des structures arborescentes
    (chez les plantes)?
  • Arbres multi-échelles
  • Invariants par transformations/réécritures

13
Algorithmique pour l'analyse de structures
biologiques
  • auto-similarité des structures arborescentes
    (chez les plantes)?
  • arbres multi-échelles
  • invariants par transformations/réécritures

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Visualisation de grandes masses de données
  • dessin de graphes critères esthétiques et
    performances
  • visualisation et fouille interactive de graphes
  • domaines applicatifs cibles bio-informatique,
    réseaux sociaux, grands réseaux dinteractions

David Auber
15
Visualisation de grandes masses de données
16
Visualisation de grandes masses de données
17
Visualisation de grandes masses de données
18
MABioVis contexte local
MABioVis 30 personnes
Gen Comp
Visu
Str Bio
UMR 5800
Europe
GRAVITÉ
MAGNOME
ANR
INRIA
Industrie
Univ Bx 2
CBiB
19
MABioVis contexte local
Contacts Guy Melançon Pascal Ferraro David
Auber David Sherman
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