1. dia - PowerPoint PPT Presentation

1 / 81
About This Presentation
Title:

1. dia

Description:

Title: 1. dia Author: BandiMaster Last modified by: Orosz L szl Created Date: 3/8/2004 9:55:05 PM Document presentation format: Diavet t s a k perny re – PowerPoint PPT presentation

Number of Views:45
Avg rating:3.0/5.0
Slides: 82
Provided by: BandiM
Category:
Tags: dia | micrococcus

less

Transcript and Presenter's Notes

Title: 1. dia


1
(No Transcript)
2
Transzdukció
Bakteriofágok közvetítte genetikai információ
csere Két fo bakteriofág típus Virulens
fágok/lítikus fágok fertozik a sejtet, gyorsan
szaporodnak, lizálják a sejtet Mérsékelt
fágok/temperált fágok fertozik a sejtet, be
tudnak épülni a genomba és profágként alvó
állapotban néha kivágódnak, szaporodnak és
lizálják a sejtet
3
Bakteriofágok morfológiája változatos RNS-t vagy
DNS-t tartalmaznak fehérje burokban Szinte
minden baktériumnak van fágja.
4
A gazdabaktériumuk sejtjének felületén lévo
specifikus receptorhoz kapcsolódnak Nukleinsavukat
a gazda sejtbe injektálják
Smithsonian (Oct 2000)
T4 bakteriofágok egy E. coli sejt felületén
5
Mérsékelt fág A gazda genomba épül be félalvó
állapot (a baktérium így lizogén bakt.) (pl. ?
bakteriofág)
6
Fágkonverzió
Az alvó profág az integrálódott bakteriofág a
mikróba fenotípusát megváltoztató géneket
hordoz - pl. a patogének és a toxin
termelés
toxin profág
inzerciós hely (att site)
Corynebacterium diptheriaea A fág génekrol
termelodik a toxin. Ez betegíti meg az embert.
C. diptheriaea A fág nélkül a törzs nem termel
toxint. Nem okoz diftériát.
7
A fágfertozés lizogén útvonala
8
Transzdukció (specializált)
  • specializált transzdukció
  • LFT, kis frekvenciájú transzdukáló lizátum
  • HFT, nagy frekvenciájú transzdukáló lizátum
  • A specializált transzdukció ? fág

9
A specializált transzdukció egyszeru mechanizmusa
10
Specializált transzdukció (Hibás kivágódás!!!)
11
Specializált transzdukció
  • ? fágnál (gal, bio markerek)
  • A profág pontatlan kivágódásával
  • A profág beépülése melletti gének is bejutnak a
    fágfejbe
  • Kis gyakoriságú jelenség
  • A hiba folytán kis valószínuséggel keletkeznek
    olyan fágok is, melyek hordoznak baktérium gént
  • LFT, kis gyakoriságú transzdukáló lizátum
  • Mivel a lambda fág fejmérete nagyobb, mint ami a
    fág DNS-hez szükséges méret (75-109)
    transzdukció esetén fág funkció sérülhet
    (defektív fág, minél nagyobb az átvitt bakterium
    DNS darab annál defektívebb a fág)

12
(No Transcript)
13
  • Ha a fág defektív, helper fág kellhet a sikeres
    lizogénia kialakításához
  • A termelésnél nincs probléma, mert a jelenlévo
    intakt fág funkciók biztosítják a normális
    muködést (többszörös genom ekvivalens)
  • Transzdukáló fággal lizogenizált baktérium is
    elofordul
  • Ugyanúgy indukálható, mint más lizogén
  • Ha defektív, akkor nem keletkezik fágrészecske
  • Ha a defektív funkciót teljes helper fággal
    kiegészítjük, indukció során az összes
    fágrészecske 50-a transzdukáló HFT High frequency

14
A virulens fágok egylépéses szaporodási
görbéje - A latencia periódus alatt a fággenom
replikálódik és a gazda genom teljesen leépül
15
A fágfertozés látható hatása a gazda DNS-re
T4 fág
DNS
Fertozés elott
Fertozés után
16
A fágfertozés lítikus ciklusa
17
Általános transzdukció (hibás pakolás!!!)
18
Transzdukció
  • DNS átvitel baktérium sejtek között bakteriofág
    segítségével
  • Általános transzdukció
  • A transzdukáló fágrészecske csak bakteriális
    DNS-t hordoz
  • Pszeudovirion, mert a saját szaporodásához
    szükséges tulajdonságokat nem hordozza

19
A fágok egy részénél fejméretu a pakolás, ami
lehet hibás is a pakoló mechanizmusnak nincs
specifikus felismero helye
Így pakol a Salmonella typhimurium P22 fágja és
B. subtilis PBS1fágja
20
Mi történik a recipiens sejteben?
21
A baktériumok közötti géncsere hatékony módja a
generalizált, vagy általános transzdukció Hibás
pakolás!!! Közeli genetikai bélyegek térképezése!
22
Példa transzdukió a Salmonella typhimurium P22
fágjával
P22 HT hatékony általános transzdukáló -
hanyag fág a fágrészecskék 50-ában gazda DNS,
azaz transzdukáló részecske ( transducing
particles TP) Minden fejben (TP) 44 kb-nyi DNS
a Salmonella genom kb. 4400 kb nagyságú Ezért,
ha a pakolás teljesen véletlenszeru, akkor 100
különbözo fágrészecske a teljes genomot
reprezentálhatja. 1011 P22 HT fág/ml
szaporítható tehát ebbol 5 x 1010 ben gazda
DNS van ? 1 ml-ben kb. 5 x 108 Salmonella
genomnyi (0.5)(1011 fág/ml)/(100 TP 1 genom)
108 genom kópia/ml a lizátumban
23
(No Transcript)
24
Transzformáció
  • Pneumococcus (Stapylococcus) Bacillus
    transzformáció
  • Kompetencia
  • DNS felvétel/bejutás
  • Donor DNS megtartása a recipiensben
  • Más transzformációs rendszerek
  • Haemophilus influenzae
  • Escherichia coli
  • Elektroporáció
  • Protoplaszt transzformáció
  • Transzfekció fág DNS-sel
  • E. coli
  • B. subtilis
  • Géntérképezés transzformációval

25
Transzformáció
  • Genetikai információátvitel (az elso amit
    felfedeztek)
  • Donor sejt nagyméretu DNS-t bocsájt ki
  • A DNS a tápközegben diffundál (a recipiens felé)
  • A DNS transzportálódik sejtfalon, sejtmembránon
    keresztül a citoplazmába, ahol rekombináció
    történik
  • Ez a transzformáció genetikai információátvitel,
    nem a normál sejtek tumorrá történo
    transzformációja (eukarióták esetén)

26
Jelentosége?
  • Mivel a DNS könnyen degradálódik, azt gondolták
    nincs valós szerepe (csak a laboratóriumban)
    Ezzel szemben számos természetes genetikai
    transzformációs rendszer létezik Achrobacter,
    Azotobacter Bacillus, Butyvibrio, Campylobacter,
    Clostridium, Hemophilus, Micrococcus,
    Mycobacterium, Neiserria, Pseudomonas,
  • Streptococcus, Streptomyces, Synechoccus
  • Valamilyen jelentoségnek kell lennie
  • Kimutatták még
  • Talajba jutattott plazmid és kromoszóma DNS
    fennmarad, mi több a Pseudomonas stutzeri és a
    Bacillus subtilis transzformálódik is
  • Egér gt DNS etetés után kimutatható a DNS a vérben
    is, így lehet olyan sejt is , amelyik felveszi (
    immunizálás )

27
Transzformáció felfedezése és utóhatásai
  • Pneumococcus
  • Sima, poliszacharid burokkal rendelkezo telep
  • patogén
  • Durva telep, kapszid poliszacharid hiánya
  • Nem patogén
  • Klasszikus transzformációs kísérlet
  • Avery kimutatja a transzformáló elv a DNS
  • Senki nem akarja elhinni
  • Hershey és Chase DNS és fehérje radioaktív
    jelölés (külön)
  • Watson és Crick, a DNS szerkezete
  • Pneuomococcus Streptococcus pneumoniae
  • Bacillus subtilis 168

28
Transzformáció
  • A transzformáció az a folyamat, amikor a sejtek
    tiszta DNS-t vesznek fel és építenek be.
  • Két fo típus
  • Természetes transzformáció (a mikróbáknak csak
    kis csoportja)
  • - általában lineáris DNS
  • 2. Mesterségesen indukált (a legtöbb, de nem az
    összes mikroorganizmus képes így DNS felvételre)
  • - általában plazmid DNS
  • Az a sejt, amelyik képes a DNS felvételére az
    kompetens.

29
Mesterséges kompetencia
A molekuláris biológia egyik legfontosabb,
alapveto technikája, lehetoség, hogy idegen DNS-t
vigyünk be a baktérium gazdába. Gyakran csak
úgy érheto el, hogy mesterséges-kompetens
sejteket készítünk. Az E. coli felvesz és
replikál gyurus DNS-t. A mesterséges
transzformáció két típusa Kémiai
kompetencia Elektroporáció/elektrotranszformáció
PROTOPLASZT PoliEtilénGlikol PEG
30
Kémiai kompetencia Néhány baktériumba, köztük az
E. coli-ba, a kétértéku kationok, kis
homérsékleten segítik a plazmid DNS felvételét (
a lineáris DNS-t is felveszik, de a citoplazma
DNáz-ai gyorsan feldarabolják, még mielott bármit
is tudna tenni) Nem teljesen világos, hogy hogyan
is van.
Felvételi csatornák poliP, PHB, és Ca
31
Elektroporáció
Nagy térerosség átmeneti lyukakat eredményez a
sejtfalban Alkalmas körülmények között a DNS
be/ki szivárog. A kinti nagy plazmid
koncentráció gyors beáramlást eredményez.
Elektroporációs küvetta
Ide kerülnek a sejtek
32
A transzformáció hatékonysága?
Transzformációs gyakoriság Sejtszámra
(transzformánsok száma/µg DNS) 106-109/µg
pBR322 kb. 1011 plazmid/µg pBR322 úgy is
mérheto, hogy a sejtek hány -a kapott plazmidot
DNS-re a DNS molekulák hány -a
transzformált sejtet
Módszer sejtszámra DNS-re
kémiai 1 12
elektro 10 90
33
Természetes kompetencia/transzformáció gram-pozití
vokban Pl. Streptococcus pneumoniae Bacillus
subtilis -nem specifikus -korlátozott száumú
felvevohely (30-75) -nick képzodés -a
komplementer szál degradálódik a felvétel
közben -rekombináció a recipiensben
34
Természetes transzformáció gram-negatív Pl.
Haemophilus influenzae Neisseriae gonorrhoeae
-szekvencia specifikus -4-8 hely/sejt -nincs
sejthez kötött intermedier -dsDNS import a
periplazmába -komplementer degradálódik a
citoplazmába történo transzport
során -rekombináció a recipiensben
35
Gram-pozitív felvevo rendszer -jó gépezet a
sejtekbe történo DNS szállításra
a konjugációs rendszer fordítottja - néhány
komponense a Tra funkciókhoz hasonlít
36
Gram-negatív felvevo gépezet -ez se rossz -
keresztezni kell a periplazmát és a külso
membránt
37
  • A folyamat energia ellátása?
  • Intracelluláris ATP hidrolízis
  • pH gradiens PMF (proton motive force)?
  • komplementer degradáció
  • Funkciója
  • Tápanyag
  • DNS repair
  • Genetikai identitás/diverzitás

38
Transzformáció
  • Kompetencia kialakulása
  • DNS kötodés és bejutás
  • A DNS integrációja a recipiens sejtben

39
Kompetencia
  • Az alapelv nagyon hasonló (természetben
    eloforduló)
  • Kompetencia az a képesség, mellyel a DNS
    megkötésre kerül, ezáltal védett lesz a
    nukleázokkal szemben
  • A kompetencia idozítése különbözik
  • Szinte minden esetben (amit tanulmányoznak)
    fejlett szabályozás alatt áll a kompetencia

40
A kompetencia fiziológiája
  • Meghatározott fiziológiai állapot
  • Valamely fejlodési szakaszhoz, vagy tápanyag
    ellátottsághoz kapcsolódik (legtöbbször, tápanyag
    hiány kialakulása kapcsolja be)
  • B. subtilis esetében homérséklet csökkenés is
    kiválthatja (42Cgt37C)
  • A szabályozó rendszerben olyan represszorok
    vannak, melyek
  • egyrészt flagella és kemotaxis géneket
  • másrészt kompetencia géneket aktiválnak

41
  • Kivételek
  • Bakteriofág is indukálhat kompetenciát
    (Staphylococcus aureus)
  • Exponenciális növekedési szakaszban alakul ki a
    kompetencia (S. pneumoniae)
  • A tenyészetben lévo kompetens sejtek száma
    változó (15 Bacillus-Streptococcus, 100)
  • A kompetencia kialakulása függ a sejtszámtól

42
  • Kompetencia kialakulása rövid ideig tart (pár
    perc)
  • Stacioner fázisban
  • Bacillusoknál, ha a kétszerezodési ido 150-390
    perc
  • Mivel kemosztát kultúrában is van kompetencia, de
    nincs sporuláció, ezért a sporuláció nem
    szükségszeruen kapcsolódik a kompetenciához
  • Hasonlóan a korai sporulációs génekben mutáns
    baktérium kompetens

43
  • A B subtilis kompetens sejtek
  • Kisebb suruséguek (gradiens centrifugálással
    elkülöníthetok a normál sejtektol)
  • Kisméretuek
  • Egy nem replikálódó genomja van
  • A kompetens sejtek membránja 4 több PHB-t
    (polihidroxi-butirát) tartalmaz, (egyébként
    raktározó szerepe van)
  • Segít egy transzmembrán csatornát kialakítani

44
  • S. penumoniae
  • Kompetens sejtek membránján kompetencia faktor
  • Ez a közegbe is kikerül
  • Ettol a nem kompetens sejtek kompetenssé válnak,
    úgy hogy a kompetencia faktor egy másik membrán
    fehérjéhez köt (comD terméke)
  • A kompetencia faktor kötésével legalább 10
    fehérje kezd el szintetizálódni
  • A kompetencia faktor megmagyarázza, miért kell
    nagy sejtsuruség, nagyobb a valószínusége, hogy
    megtalálja a receptorát
  • A com lókusz mutációi megakadályozzák a
    kompetencia kialakulását

45
  • comA terméke hasonlít az ATP függo transzport
    fehérjékhez (melyek toxin fehérjéket szállítanak
    a sejt felszínére, coli hemolizin gén)
  • A kompetencia kialakulásával a sejtfal
    porózusabbá válik
  • Az autolitikus enzimaktivitás növekszik
  • Baktérium sejtek láncolata hosszabb lesz
  • A legtöbb változás a sejt egyenlítoi síkjában
    következik be, ahol a növekedés történik, és ahol
    a DNS felvétel történik

46
DNS kötés
  • Kompetens és nem kompetens sejt is köt DNS-t
  • A nem kompetens sejtben lemosható a DNS, a
    kompetens sejtben nem mosható le egyszeruen
  • EDTA hatására a DNS megkötodik, de minden további
    feldolgozás megáll
  • Kb. 50 DNS köto hely van a kompetens B. subtilis
    felszínén
  • A kötött DNS érzékeny a nukleázokra és a
    nyíróerokre
  • Bármilyen eredetu DNS kötodhet
  • Minimum 500 bp hosszú fragmens kell a kötéshez
  • Egyszálú, glükozilált DNS, ds RNS, RNS-DNS hibrid
    nem kötodik

47
DNS bejutás
  • A következo lépés a DNS bejutása a sejtbe
  • A 3 végtol kezdve
  • A bejutás elott a kötohely melletti endonukleázok
    megfelelo méretre hasítják a DNS-t
  • Véletlenszeru hasítás
  • Eredmény 15 kb-nál nem nagyobb DNS fragmensek
    (kisebb, mint amekkorát a transzdukáló fágok
    bejuttatnak)
  • Az endonukleázoknak magnéziumra vagy kalciumra
    van szükség (ezért érzékeny az EDTA-ra)
  • Ebben a fázisban, ha szétválasztjuk a DNS-t és a
    sejteket a kettos szálú DNS alkalmas a
    transzformációra

48
  • Következo lépés az eklipsz komplex kialakulása
  • A DNS kötodik egy kompetencia specifikus
    fehérjéhez
  • Ezáltal a DNS egyszálú lesz
  • Védett lesz a külso nukleáz hasítással szemben
  • Teljesen véletlenszeru, hogy melyik szál hasad le
    és az is, hogy milyen helynél kezdodik a hasítás
  • A lebomlott szál nukleotidjai a médiumba kerülnek

49
(No Transcript)
50
Mi magyarázza a transzformáció jelenségét
  • Genetikai átváltozás
  • Energia az elbontott DNS szálból
  • Önmagában egyik sem magyarázza, de a ketto együtt
    igen

51
  • Elektronmikroszkópos felvételek
  • Adhéziós zónához hasonló részek a kompetens
    sejtekben (mint a T4 fág infekciókor)
  • A bakteriális kromoszóma membránhoz kötött, a
    transzformáló DNS közvetlenül a célhoz jut
  • Normál proton gradiens szükséges a DNS bejutáshoz
    (B. subtilis), ATP kell Streptococcus-nál
  • A kompetencia indukció része a RecA és egy
    kapcsolódó fehérje (kolligrin) termelése
  • A kolligrin membrán fehérje a RecA-t segíti a
    membránban
  • Így a bejutó DNS rögtön rekombinációba lép (mert
    S. pneumoniae elektroporációval nem
    transzformálható)

52
A donor DNS sorsa
  • Kompetens sejt homológ (saját) és heterológ
    (idegen) DNS-t is köt
  • Mindketto egyszálú is lesz az internalizációkor
  • Genetikai kicserélodés során kell lenni olyan
    folyamatnak, mely megakadályozza idegen DNS
    honosítását
  • Bacillus és Streptococcus a rekombináció során
    diszkrimiál. Különbséget tesz idegen és saját
    (faj) DNS-e között

53
  • Korrekt hidrogén hídkötés szükséges, ahol nincs
    ott nincs rekombináció és kizáródik a heterológ
    DNS
  • Rekombinációban deficiensnél nincs transzformáció
  • A rekombináció indukciója (nick-ek a recipiens
    DNS-ben) javítja a transzformáció hatékonyságát

54
(No Transcript)
55
  • Az egyszálú DNS D-loop kialakításával kicseréli a
    recipiens homológ darabjátgttranziens heteroduplex
    alakul ki
  • A hetroduplexben lehet néhány rossz párosodás,
    ezt a repair enzimek javítják
  • A javítástól függoen elveszhetnek transzformánsok
  • S. pneumoniae esetén Hex rendszer
  • A Hex fehérje bizonyos helyeket felismer a
    genomon
  • A helyek körül kijavítja a hibákat
  • Azok a markerek, amelyek Hex felismero hellyel
    rekombinálnak elvesznek LE (low efficiency)
  • Hex helytol távolabbi markerek nem vesznek el HE
    (high efficiency)
  • a hex limitje a fehérje molekulák száma (ha sok
    transzformáló DNS-t adunk, telítodik a hex
    rendszer

56
Plazmid transzformáció
  • Önállóan képes replikálódni, ha bejutott
  • DE!! A bejutás során linearizálódik
  • Egyszálú DNS-ként jut a citoplazmába, pedig a
    replikációhoz kétszálúnak kell lennie
  • Egy plazmid molekula nem ad transzformánst,
    szinte mindig extra DNS is található
  • Hogyan oldható meg, a recipiensben kell homológ
    DNS (vagy kromoszóma, vagy plazmid)
  • Ha van homológ darab, akkor rekombinálódhat,
    cirkularizálódhat
  • Ha homológ DNS darab kötodik a vektorhoz, akkor
    nagy gyakoriságú transzformációt kapunk
  • Marker rescue (ha rezidens plazmidot használunk a
    transzformánsok visszanyerésének növeléséhez)

57
(No Transcript)
58
Más transzformációs rendszerek
59
Hemophilus influenzae
  • Gram negatív organizmus
  • Kompetencia kialakulása tápanyaghiányra
  • Nukleinsav szintézis gátlás 100 kompetencia
    (fehérje szintézis esszenciális)
  • Nincs kompetencia specifikus fehérje
  • Csak más Hemophilus fajból vesz fel DNS-t
  • A DNS-en kell lennie egy 11 bp-os darabnak
  • Ez kötodik a sejt membránhoz

60
  • DNS bejutása más
  • Belso membrán kitüremkedik, kialakul a
    transzformaszóm
  • Donor DNS kapcsolódik a receptorhoz
  • Plazmid transzformáció nagyon kis gyakorisággal
  • Noha ds DNS jut be a transzformaszómba a
    rekombináció egyszálú DNS-el jön létre

61
(No Transcript)
62
E. coli transzformáció
  • Természetes körülmények között (spontán) nem
    transzformálódik
  • Különleges esetekben kompetenssé válik
  • Szferoplaszt
  • Kalcium koncentráció, hosokk (90 sejthalál)
  • Kobalt klorid és DMSO befolyásolja
  • Subtilis-hez hasonlóan PHB halmozódik a
    membránban (kompetens sejtnél)
  • Szabályozott folyamat, PHB szintézist a Ca
    elosegíti
  • Plazmid DNS-el simán transzformálható, mert nem
    linearizálódik ezért fontos!!!! (lineáris DNS
    kisebb hatékonyság 1000)

63
  • Lineáris DNS-el nem transzformálható
  • Exonukleáz V bontja a DNS-t (ezt a rolling circle
    replikációhoz ki kell kapcsolni, lambdánál)
  • Legtöbb transzformált coli törzs recB, recC (ExoV
    inaktív) és sbcB (rekombináció hiány szupresszor)
  • Természetes transzformáció gátjai
  • Nincs kompetencia (spontán)
  • ExoV jelenléte
  • Mindkettot ki lehet küszöbölni laboratóriumi
    körülmények között

64
Elektroporáció
  • Elektro transzformáció
  • Nagy feszültségu áram baktérium szuszpenzión
    keresztül
  • Kis lyukak keletkeznek a sejtfalon
  • Kis méretu plazmidok, vektor konstrukciók
    átjutnak
  • Bejutás után hasonló, mint a többi
  • Nagy sejtpusztulás, de sok baktériumsejtet lehet
    alkalmazni, elegendo a legtöbb kísérlethez
  • E. coli esetén a leghatékonyabb (nagyobb
    transzformációs gyakoriság, nagyobb méretu DNS)

65
(No Transcript)
66
Transzfekció
  • A donor DNS forrása nem baktérium sejt, hanem
    bakteriofág
  • Az eredmény infekciós centrum, azaz plakk
  • A hatékonyság plakk vizsgálattal végezheto
  • Elonye
  • A DNS populáció egységes
  • Így követheto a DNS sorsa a transzformáció
    lépéseiben
  • Vizsgálható a transzformáció jelensége
  • Hasznos volt a rekombináció és repair
    tanulmányozásához (mesterséges heteroduplexeket
    hoztak létre fág és más DNS-el és vizsgálták a
    rekombinációt, javítást)

67
Térképezés transzformációval
  • Gének kapcsoltságának megállapítása
    transzformációval
  • Transzdukcióhoz hasonló elv
  • Ha két távoli gént veszünk, azok egyszerre csak
    akkor transzformálhatnak, ha egy sejt egyszerre
    két DNS darabot épít be (egyik az egyik, másik a
    másik génnel)
  • A közeli géneknél (kapcsolt) az együttes
    transzformánsok úgy is létrejöhetnek, hogy
    mindkét gén egy fragmensen van

68
  • A csökkeno mennyiségu DNS-el történo
    transzformáció során kapcsolt gének esetén a
    recipiens egyszeres és kétszeres
    transzformánsainak száma megegyezik (mert a két
    gén ugyanazon a transzformáló donor DNS-en
    helyezkedik el)
  • Távoli gének esetén, nagyobb a valószínusége
    annak, hogy külön DNS-en vannak, azaz, ha
    higítjuk a transzformáló DNS-t elobb utóbb, csak
    az egyik, vagy csak a másik gént tartalmazó
    DNS-el történik a transzformáció

69
(No Transcript)
70
  • A két gén egyedi transzformációs gyakoriságának
    meghatározása után a két gyakoriságot
    összeszorozzuk (ez a várható transzformációs
    gyakoriság, ha a két gén nem kapcsolt)
  • Ezt az értéket összehasonlítják a kétszeres
    transzformációs gyakorisággal, ha az utóbbi
    nagyobb, mint a várt érték, azaz az egyszeres
    transzformánsok gyakoriságához közelít, akkor a
    két gén kapcsolt

71
  • Feltételezés
  • A transzformáló keverékben ismert méretu és
    azonos nagyságú DNS darabok vannak
  • A donor DNS átlagos nagyságától függ, hogy két
    gén kapcsolt-e
  • Nagyobb DNS darabok esetén távolabbi gének is
    kapcsoltnak mutatkoznak
  • A kapcsoltság így megállapítható
  • Ha A gén kapcsolt B-vel, B gén kapcsolt C-vel,
    akkor a sorrend ABC

72
Géncsere/Genetikai térképezés baktériumokban
  • Transzformáció, transzdukció és konjugáció

73
(No Transcript)
74
Genetikai információ átvitel baktériumokban
  • Mindíg egy irányú donorból a recipiensbe
  • Gének sorrendjének meghatározása
  • Kapcsoltság
  • Szelektált/nem szelektált marker
  • Két és három pontos térképezés
  • Genetikai és fizikai térkép

75
B. subtilis transzformációja
76
(No Transcript)
77
(No Transcript)
78
  • Térképezés transzformációval
  • A rekombinációs gyakoriságokból következtetünk a
    gének sorrendjére.
  • p q o x p q o
  • Ha p és q kotranszformációja gyakori, akkor a
    sorrend
  • p-q-o.
  • Ha p és o kotranszformációja gyakoribb,
    akkor
  • p-o-q.

79
Genetikai térképezés transzformációval
Donor sejtbol DNS darabolódás
a b
b
a
a-b- recipiens transzformációja
Ha ab kapcsoltak (fizikailag közel vannak
egymáshoz), ab, ab- és a-b rekombinánsokat
kaphatunk. Ha nem szorosan kapcsoltak, akkor
csak ab- vagy a-b . Transzformált,
transzformáns.
80
PROTOPLASZT
  • Baktérium, gomba, növény, állat sejtekbol
    protoplaszt
  • DNS PEG
  • Protoplaszt készítés sejtfalbontó enzimekkel
    lizozim, cellulázok, proteázok, mihez mi kell

81
KÉMIAI KOMPETENCIA
  • Li-acetát S. cerevisiae
  • KCl B. subtilis
Write a Comment
User Comments (0)
About PowerShow.com