SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA - PowerPoint PPT Presentation

Loading...

PPT – SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA PowerPoint presentation | free to download - id: 7ba865-ZDlhM



Loading


The Adobe Flash plugin is needed to view this content

Get the plugin now

View by Category
About This Presentation
Title:

SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA

Description:

Title: BIOKIMIA Author: Donny Widianto Last modified by: Irfan Created Date: 8/28/2006 2:44:24 AM Document presentation format: On-screen Show Company – PowerPoint PPT presentation

Number of Views:140
Avg rating:3.0/5.0
Slides: 40
Provided by: Donny151
Learn more at: http://gatotadinugroho.weebly.com
Category:

less

Write a Comment
User Comments (0)
Transcript and Presenter's Notes

Title: SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA


1
SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA
2
Tujuan Perkuliahan
  • Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia
    Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa
    (reaksi-reaksi kimia), struktur kalimat (Jalur
    metabolisme) dan arti (keterkaitan metabolik)

3
Apa itu Biokimia?
  • Definisi
  • Websters dictionary Bios Yunani, artinya
    hidup Kimia mahluk hidup Kimia yang terjadi
    dan menjadi ciri kehidupan.
  • WebNet dictionary Biokimia adalah kimia dari
    bahan-bahan dan proses-proses yang terjadi dalam
    tubuh mahluk hidup sebagai upaya untuk memahami
    proses kehidupan dari sisi kimia.

4
Apa itu biokimia?
  • Pemahaman bentuk dan fungsi biologis dari sudut
    pandang kimia
  • Bertujuan untuk memahami interaksi
    molekul-molekul tak hidup yang menghasilkan
    fenomena kompleks dan efisien yang menjadi
    ciri-ciri kehidupan serta menjelaskan keseragaman
    kimia dari kehidupan yang beragam.

5
Hal-hal yang dipelajari
  • Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekul
    biologi
  • Interaksi antar biomolekul
  • Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel
  • Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel
  • Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan
    pengkoordinasian aktifitasnya
  • Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi informasi
    genetika

6
Sejarah Biokimia
  • Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk
    hidup.

Unsur kimia utama penyusun mahluk hidup adalah
bahan minor penyusun kerak bumi (kandungan utama
47 O, 28 Si, 7.9 Al, 4.5 Fe, dan 3.5 Ca).
Enam unsur utama penyusun sel hidup adalah C, H,
N, O, P, dan S.
99 penyusun sel adalah H, O, N, dan C 99 penyusun sel adalah H, O, N, dan C 99 penyusun sel adalah H, O, N, dan C
Unsur Elektron bebas Jumlah Fraksi
H 1 2/3
O 2 1/4
N 3 1/70
C 4 1/10
7
Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup
memiliki berat atom yang rendah H, O, N dan C
adalah unsur dengan berat atom relatif paling
kecil yang masing-masing mampu membentuk ikatan
tunggal, rangkap, rangkap 3 dan rangkap 4.
Unsur dengan berat atom paling ringan membentuk
ikatan paling kuat
8
Sejarah Biokimia
  • Kemudian, identifikasi tipe molekul yang
    ditemukan dalam mahluk hidup
  • Asam Amino
  • Nukleotida
  • Karbohidrat
  • Lipida

9
Sejarah Biokimia
  • Selanjutnya memahami mekanisme biomolekul membuat
    mahluk hidup menjadi hidup

10
Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya
  • Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat
    biomolekul.
  • Biofisika, yang memanfaatkan teknik-teknik fisika
    untuk mempelajari struktur biomolekul.
  • Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang
    metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan makanan
    bagi mahluk hidup mempertahankan kehidupan
    normalnya.
  • Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang keadaan
    sakit dari sudut pandang molekular.

11
Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya
  • Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa organisme
    sel tunggal dan virus cocok untuk digunakan
    sebagai sarana mempelajari jalur-jalur
    metabolisme dan mekanisme pengendaliannya.
  • Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan pada
    tingkat jaringan dan organisme.
  • Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja
    biokimia dalam sel.
  • Genetika, yang mempelajari mekanisme penyusunan
    identitas biokimia sel.

12
ENERGI, hal yang perlu diketahui adalah cara
Tiga hal yang dibutuhkan sel
  • Memperolehnya
  • Mengubahnya
  • Memanfaatkannya

13
(2) MOLEKUL SEDERHANA , hal yang perlu diketahui
adalah cara
Tiga hal yang dibutuhkan sel
  • Mengubahnya
  • Mempolimerisasikannya
  • Mendegradasinya

14
(3) MEKANISME KIMIA, untuk
  • Memperoleh energi
  • Menjalankan reaksi kimia secara berurutan
  • Mensintesis mendegradasi makromolekul
  • Mempertahankan suatu keadaan steady state yang
    dinamis
  • Swarakit kembali struktur yang kompleks
  • Menggandakan diri secara akurat dan efisien
  • Mempertahankan keteraturan proses biokimia

15
Strategi sel 1 mahluk hidup menggunakan sistem
reaksi kimia berpasangan untuk mendorong reaksi
yang sulit terjadi
16
Strategi sel 2 mahluk hidup menggunakan enzim
untuk mempercepat reaksi yang semestinya lambat
17
Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi?
Penjelasan termodinamis
18
Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi?
Penjelasan mekanistis
19
Atom Karbon yang sangat lentur merupakan
tulangpunggung kehidupan
20
Konversi isomer kimia membutuhkan pemutusan
ikatan kovalen
21
Stereoisomers Sama secara kimia, berbeda secara
biologi
22
Stereoisomers Sama secara kimia, berbeda secara
biologi
23
Transformasi Biokimia dapat dikelompokkan ke
dalam 5 kelompok besar
  • Reaksi pemindahan Group
  • Reaksi Oksidasi-reduksi
  • Penyusunan kembali Rearrangements
    (isomerizations)
  • Reaksi pemotongan
  • Reaksi kondensasi

24
Biomolekul Struktur
  • Senyawa Pembangun
  • Gula sederhana
  • Asam amino
  • Nukleotida
  • Asam lemak
  • Makromolekul
  • Polisakarida
  • Protein (peptida)
  • RNA or DNA
  • Lipid

25
Biosintesis Membutuhkan molekul sederhana untuk
dirangkai secara kovalen melalui berbagai
kombinasi
26
1. Keelektronegatifan kedua atom
Kekuatan ikatan kimia dipengaruhi oleh
Keelectronegatifan tinggi Kebutuhan akan elektron
  • P 2.1
  • H 2.1
  • Na 0.9
  • K 0.8
  • O 3.5
  • Cl 3.0
  • N 3.0
  • C 2.5

27
2. Jumlah elektron yang berikatan
28
Kekuatan beberapa ikatan kimia
Approx. Avg.
Triple 820 kJ/mole
Double 610 kJ/mole
Single 350 kJ/mole
29
Gugus Fungsi yang Umum
30
Nukleofil Biologi yang PentingGugus fungsi
yang kaya elektron
31
BIOKIMIA (MKS1002A)
  • drs. Winarto Hariadi, M.Si.
  • Dr. Sedyo Hartono
  • Dr. Irfan D. Prijambada

32
Jadual SAP
No. Topik Kuliah Tanggal Dosen
1. Pendahuluan - Konsep dasar biokimia - Reaksi-reaksi biokimia 27-08-2007 Dr. Irfan D. Prijambada
2. Air dan Buffer 03-09-2007 Drs. Winarto Hariadi, M.Si.
3. Karbohidrat I - Tinjauan umum - Monosakarida - Disakarida - Polisakarida 10-09-2007 Drs. Winarto Hariadi, M.Si.
4. Karbohidrat II - Reaksi monosakarida - Ikatan glikosida - Fungsi karbohidrat 17-09-2007 Drs. Winarto Hariadi, M.Si.
5. Asam Amino dan Protein I - Tinjauan umum - Asam Amino - Biosintesis asam amino 24-09-2007 Drs. Winarto Hariadi, M.Si.
33
Jadual SAP
No. Topik Kuliah Tanggal Dosen
6. Asam Amino dan Protein II - Peptida - Struktur protein - Fungsi asam amino dan protein - Biosintesis protein 01-10-2007 Dr. Irfan D. Prijambada
7. Ujian tengah semester Jadual dari Fakultas Topik Kuliah 1 s/d 6
8. Lipida I - Tinjauan umum - Asam lemak jenuh tak jenuh - Reaksi asam lemak 05-11-2007 Dr. Irfan D. Prijambada
9. Lipida II - Fungsi asam lemak dan lipid - Biosintesis asam lemak 12-11-2007 Dr. Irfan D. Prijambada
34
Jadual SAP
No. Topik Kuliah Tanggal Dosen
10. Asam nukleat I - Tinjauan umum - Nukleosida dan nukleotida 19-11-2007 Dr. Sedyo Hartono
11. Asam nukleat II - Struktur DNA dan RNA - Informasi genetik 26-11-2007 Dr. Sedyo Hartono
12. Enzim - Tinjauan umum - Klassifikasi enzim - Koenzim dan kofaktor - Mekanisme dan kinetika kerja enzim - Penghambatan 03-12-2007 Dr. Sedyo Hartono
35
Jadual SAP
No. Topik Kuliah Tanggal Dosen
13. Metabolisme I - Tinjauan umum - Jalur metabolisme 10-12-2007 Dr. Sedyo hartono
14. Metabolisme II - Bioenergetika - Kontrol metabolisme 17-12-2007 Dr. Sedyo Hartono
15. Ujian Akhir Semester Jadual dari Fakultas Topik Kuliah 8 s/d 14
36
Buku Acuan
  • Trudy McKee and James McKee. 2003. Biochemistry
    The Molecular Basis of Life. Third edition.
    McGraw-Hill, Boston.
  • Lehninger, Nelson, Cox. 1997. Principles of
    Biochemistry.2nd edition. Worth Publishers.
  • Albert L. Lehninger. 1995. Dasar-dasar Biokimia.
    (Alih bahasa Maggy Thenawidjaja). Penerbit
    Erlangga, Jakarta.
  • David S. Page. 1995. Prinsip-prinsip Biokimia.
    Penerbit Unair, Surabaya.
  • Soeharsono. 1982. Biokimia I dan II. Gadjah Mada
    University Press, Yogyakarta.

37
Penilaian
  • Total Nilai Ujian Mid Tugas dari 4 dosen
    dibagi 4
  • (Rata-rata dari Nilai Dosen I II III IV)
  • Pengharkatan
  • A gt rata-rata kelas 1,5 x stdev
  • B lt rata-rata kelas 1,5 x stdev
  • gt rata-rata kelas 0,5 x stdev
  • C lt rata-rata kelas 0,5 x stdev
  • gt rata-rata kelas 0,5 x stdev
  • D lt rata-rata kelas 0,5 x stdev
  • gt rata-rata kelas 1,5 x stdev
  • E lt rata-rata kelas 1,5 x stdev

38
Tata Tertib Kuliah
  • Tepat waktu, toleransi maks. 15 menit
  • Tidak Berisik
  • HP tidak diaktifkan
  • Hadir minimal 70
  • Paham bahasa Indonesia Inggris
  • Baca salah satu / dua buku acuan
  • Kerjakan Tugas, Mid, Ujian

39
Kesimpulan
  • Karbon dengan struktur tetrahedral memiliki sifat
    ikatan yang luwes
  • Senyawa yang memiliki banyak atom dapat memiliki
    bentuk isomerik
  • Untuk konversi perlu terjadinya pemecahan ikatan
    kimia
  • Molekul berukuran besar dibentuk oleh molekul
    berukuran kecil melalui pembentukan ikatan baru
About PowerShow.com