Tri Externe

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Tri Externe

• Chapitre 13 13.113.5

2
Pourquoi Trier?

• Problème classique en informatique (Voir Knuth,
  v.3)!
• Données requises en ordre trié
• P.ex. Trouver les étudiants en ordre croissant
  de gpa
• Chargement en vrac de lindex à arbre B
• Élimination des duplicatas dans une collection
  denregistrements
• Algorithme de merge-sort join (jointure à
  tri-fusion)
• Problème commun trier des données trop larges
  pour tenir en mémoire

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Merge Sort à 2 Voies Requiert 3 Tampons

• Passage 1 Lire une page, la trier (en mémoire),
  lécrire sur disque.
• seulement une page tampon utilisée
• Passage 2, 3, , etc.
• trois pages tampon utilisées

ENTREE 1
SORTIE
ENTREE 2
Mémoire principale
Disque
Disque
4
Merge Sort Externe à 2 Voies
Fichier
6,2
2
3,4
9,4
8,7
5,6
3,1

• A chaque passage on lit et écrit chaque page du
  fichier gt 2N I/Os par passage.
• N pages dans le fichier gt
• de passages
• Doù le coût total est
• Idee Divide et impera trier des sousfichiers
  et fusionner.
• Dans lexemple, le fichier dentrée contient 7
  pages les pages noires montrent ce qui se
  passerait avec 8 pages.

PASSAGE 0
runs de 1page
1,3
2
3,4
5,6
2,6
4,9
7,8
PASSAGE 1
4,7
1,3
2,3
runs de 2 pages
8,9
5,6
2
4,6
PASSAGE 2
2,3
4,4
1,2
runs de 4 pages
6,7
3,5
6
8,9
PASSAGE 3
1,2
2,3
3,4
runs de 8 pages
4,5
6,6
7,8
9
5
Merge Sort à 2 Voies Algorithme

• proc two-way_extsort(file)
• // Trier un fichier sur disque en utilisant 3
  pages tampons
• // Passage 0 produit des runs dune page
• Lire chaque page du fichier dans la mémoire, le
  trier et lécrire.
• //Fusionner des paires de runs pour produire de
  plus long runs
• // jusquà ce quil ne reste quun seul run
• While de runs à la fin du passage précédent gt
  1 do
• //Traiter les passages i1,2,
• While il y a des runs à fusionner issus du
  passage précédent do
• Prendre les 2 runs suivants du
  passage précèdent.
• Lire chaque run dans un tampon dentrée, 1
  page à la fois.
• Fusionner les runs et écrire le résultat dans
  le tampon de sortie en
• forçant le contenu de ce tampon vers le disque
  page par page.
• endproc

6
Merge Sort Externe Général

• Comment utiliser plus de 3 tampons?
• Pour trier un fichier avec N pages en utilisant B
  pages tampon
• Passage 0 utiliser B pages tampon. Produit
  runs triés de B pages chacune.
• Passage 2, , etc. fusionner B-1 runs.

ENTREE 1
. . .
. . .
ENTREE 2
. . .
SORTIE
ENTREE B-1
Disque
Disque
B tampons en mémoire
7
Merge Sort Externe Général Algorithme

• proc two-way_extsort(file)
• // Trier un fichier sur disque en utilisant B
  pages tampons
• // Passage 0 produit des runs de B pages
• Lire B pages du fichier dans la mémoire, les
  trier et les écrire.
• //Fusionner B-1 runs pour produire de plus long
  runs
• // jusquà ce quil ne reste quun seul run
• While de runs à la fin du passage précédent gt
  1 do
• //Traiter les passages i1,2,
• While il y a des runs à fusionner issus du
  passage précédent do
• Prendre les B-1 runs suivants du
  passage précèdent.
• Lire chaque run dans un tampon dentrée, 1
  page à la fois.
• Fusionner les runs et écrire le résultat dans
  le tampon de sortie en
• forçant le contenu de ce tampon vers le disque
  page par page.
• endproc

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Coût du Merge Sort Externe

• Nombre de passages
• Coût 2N ( de passages)
• P.ex., avec 5 pages tampon, trier un fichier de
  108 pages
• Passage 0 22 runs triés de 5
  pages chacune (le dernier nayant que 3 pages)
• Passage 1 6 runs triés de 20
  pages chacune (le dernier avec seulement 8 pages)
• Passage 2 2 runs triés, 80 pages et 28 pages
• Passage 3 fichier trié de 108 pages

9
Nombre de Passages du Triage Externe
10
I/O pour le Merge Sort Externe

• de plus longs runs signifient souvent moins de
  passages!
• Les algorithmes présentés font des I/O dune page
  à la fois.
• En pratique, on lit un bloc de pages
  sequentiellement!
• Suggestion les tampons devraient contenir des
  blocs de pages et non des pages individuelles.
• En pratique, la plupart des fichiers sont triés
  en 2-3 passages.
• Des DBMSs typiques trient 1M denreg.s de la
  taille de 100 bytes en 15 minutes.

11
Nombre de Passages du Triage Optimisé

• Taille des Blocs 32, le passage initial
  produit des runs de 2B.

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Double Tampons

• Afin de réduire le temps dattente pour que une
  requête I/O soit complétée, on peut prélire les
  données dans un bloc de réserve.
• Potentiellement, plus de passages sont possibles
  en pratique, la plupart des fichiers sont
  toujours triés en 2-3 passages.

ENTREE 1
ENTREE 1'
ENTREE 2
SORTIE
ENTREE 2'
SORTIE'
b
Taille de bloc
Disque
ENTREE k
Disque
ENTREE k'
B tampons en mémoire, fusion à k voies
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Utilisation des Arbres B pour Trier

• Scénario La table à trier a un indexe à arbre B
  sur les colonnes de triages.
• Idée Puiser les enregistrements dans lordre en
  traversant les feuilles de lindexe.
• Est-ce une bonne idée ?
• Cas à considérer
• Lindex B est groupé Bonne idée!
• Lindex B est non groupé Pourrait être une
  très mauvaise idée!

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Index B Groupé Utilisé pour Trier

• Coût partir de la racine à la feuille la plus à
  gauche et de là traverser toutes les pages
  feuilles (Alternative 1)
• Si lalternative 2 est utilisée? Coût
  additionnel de puiser les enreg.s des données
  chaque page puisée juste une fois.

Index
(Oriente la recherche)
Entrees des donnees
("Sequence set")
Enregistrements des données

• Toujours meilleur que le triage externe!

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Index B Nongroupé Utilisé pour Trier

• Alternative (2) pour les entrées des données
  chaque entrée contient le rid dun enregistrement
  des données. En général, un I/O par
  enregistrement des données!

Index
Entrées des données
Données
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Résumé

• Le triage externe est important un SGBD peut
  dédier une partie de la réserve des pages tampon
  juste pour cette tâche!
• Le merge sort externe minimalise les coûts des
  entrées et sorties vers le disque
• Passage 0 Produit des runs triés de taille B (
  de page tampon). Les passages suivants sont des
  runs de fusion.
• Le de runs fusionnés à la fois dépend de B et
  de la taille du bloc.
• Bloc de large taille gt petit de runs à
  fusionner.
• Les index à arbre B groupé sont bons pour le
  triage externe les index nongroupés sont
  généralement très mauvais.