Detecci

1
Curso Universitario de Postgrado de
Cardiología Facultad de Ciencias
Médicas Universidad Nacional de Rosario Santa Fe,
Argentina, 13 de septiembre de 2004
Informática Médica Detección yacceso a la
información científica
Prof. Dr. Armando Pacher Bioingeniería -
Universidad Nacional de Entre Ríos CETIFAC
Centro de Teleinformática de laFederación
Argentina de Cardiología - FAC
2
Encuesta n28
3

• Localización de información científica en
  Internet
• Dónde buscar la información
• Estrategias y tácticas de búsqueda (AND OR NOT,
  etc.)
• Utilización de PubMed Medline y sus
  herramientas
• Utilización de BIREME-LILACS

4
Aspectos generales

• Se asume que los asistentes saben cómo
  conectarse a Internet y utilizar un Browser o
  Navegador.
• La charla de esta noche puede continuar en forma
  virtual y permanente en el Foro de Informática
  en Cardiología de FAC
• cursofac_at_fac.org.ar
• El material que se proyectará se encuentra en la
  Web
• www.fac.org.ar/fec/cursofac/fmsfe04
• Materiales relacionados
• www.fac.org.ar/fec/cursofac

5
(No Transcript)
6
Localización de la información científica

• Tipos de información
• Documentos, imágenes, trabajos científicos.
• Al ser no controlada, Internet tiene contenidos
  que representan un libre muestrario de la
  Humanidad
• es necesario filtrar para separar la paja del
  trigo.
• Dónde se encuentra la información filtrada?
• En sitios de instituciones académicas y
  científicas y bibliotecas (en general son sitios
  cuyas direcciones tienen la extensión .edu .org
  .gov).

7
Localización de la información científica

• Se localiza información
• A través de la Web
• accediendo a sitios institucionales y bibliotecas
  
• con programas llamados Buscadores o Searchers
• accediendo a Medline
• accediendo a Bireme-Lilacs

8
Web World Wide Web

• Conforma una telaraña (web) de información
  multimedial

9
Web World Wide Web

• La Web es multimedial su interfaz integra datos,
  audio y video y los enlaza mediante hipertextos.

Tim Berners-Lee - 1990 CERN Laboratorio Europeo
de Física de Partículas
10
Web World Wide Web

• Los hipertextos (hipervínculos o links) enlazan
  documentos y los ofrecen a distancias de uno o
  pocos clicks, aunque el material se encuentre en
  computadoras separadas por miles de kilómetros.

2do click
1er click
3er click
11
Localización de la información científica

• Se localiza información
• A través de la Web
• accediendo a sitios institucionales y
  bibliotecas
• Federación Argentina de Cardiología
• www.fac.org.ar

12
1er click
13
3er click
2do click
Sitios institucionales
14
Sitios institucionales una distancia de tres
clicks
15
Organizaciones internacionales a tres clicks
16
Múltiples instituciones a tres clicks
17
Universidades a tres clicks
18
Certificación de ética y calidad en la
información científicaRigurosidad en el
filtrado yacreditación de sitios
19
Acreditación
20
Certificación deacreditación
21
Principios
22
Principios
23
MedHuntBúsqueda de informaciónen sitios
certificadospor HonCode
24
click
Sitios institucionales Ateneos
25
click
Sitios institucionales Ateneos
26
Sitios institucionales Ateneos
27
Sitios institucionales
28
Sitios institucionales Congresos
29
Sitios institucionalesWebcast de Congresos
30
Sitios institucionalesWebcast de Congresos
31
Sitios institucionalesWebcast de Congresos
32
Sitios institucionales Conferencias
33
Sitios institucionales congresos a través de
Internet
34
Sitios institucionales congresos a través de
Internet
35
Sitios institucionales congresos a través de
Internet
36
Interactividad con conferencistas
37
Información filtradapara pacientes
yfamiliares en sitiosinstitucionales
38
Localización de la información científica

• Se localiza información
• A través de la Web
• accediendo a sitios institucionales y bibliotecas
  
• con programas llamados Buscadores o Searchers
• accediendo a Medline
• accediendo a Bireme-Lilacs

39
Buscadores o Searchers

• Google
• Copernic
• Yahoo!
• Webcrawler
• Metacrawler
• Lycos
• Excite
• Infoseek
• HotBot
• otros (Magellan, EuroSeek, Altavista, Fast
  Search, Direct Hit, YellowPages, Albert, etc.,
  etc. etc.)
• Información no filtrada salvo la de
  instituciones científicas y académicas.

Utilizar uno o a lo sumo dos y aprender a fondo
sus funcionamientos(cada uno tiene sus propias
reglas)
40
Buscadores o Searchers
Supongamos una búsqueda de un tema de actualidad,
como apoptosis, utilizando como buscador a
Google
41
(No Transcript)
42
?1.700.000 citas
43
Es imprescindible limitar las búsquedas en la Web

• Utilización de operadores lógicos
• AND
• OR
• NOT

Recordar la Teoría de Conjuntos Conjunto A y
Conjunto BIntersección - Unión - Diferencia
44
Limitar las búsquedas en la Web

• Operador AND ( Y)

Intersección
A Y B arritmia AND ventricular localiza
trabajos que incluyan la palabra arritmia y la
palabra ventricular
45
Limitar las búsquedas en la Web

• Operador OR ( O)

Unión
A OR B arritmia OR ventricular localiza
trabajos que incluyan la palabra arritmia o la
palabra ventricular
46
Limitar las búsquedas en la Web

• Operador NOT ( NO)

Diferencia
A NOT B arritmia NOT ventricular localiza
trabajos que incluyan la palabra arritmia pero no
ventricular
47
Operadores AND OR NOT

• arrhythmia AND ventricular
• encuentra trabajos de arritmia ventricular
• arrhythmia OR ventricular
• encuentra tanto trabajos de arritmia como
  trabajos que tengan la palabra ventricular
• arrhythmia NOT ventricular
• encuentra trabajos de arritmia no ventricular
  

48
Operadores AND OR NOT combinaciones

• arrhythmia AND ventricular NOT ischemia
• encuentra trabajos de arritmia ventricular sin
  isquemia
• arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT
  ischemia
• encuentra trabajos de tratamiento de arritmia
  ventricular sin isquemia
• arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND
  treatment NOT ischemia
• encuentra trabajos de tratamiento de arritmia
  ventricular no sostenida sin isquemia

49
Acotando la búsqueda con operadores combinados
50
(No Transcript)
51
(No Transcript)
52
AND
OR
Opción de búsquedas avanzadas
NOT
53
Limitar las búsquedas en la Web

• Equivalencias
• AND
• OR
• NOT -
• Inclusión de frases
• "radiation induced apoptosis
• coronary stents
• Estudiar los comandos de cada Searcher
• ? , ltfrasegt () ltNEARgt ltNEAR/Ngt etc., etc.

54
(No Transcript)
55
Utilización del cachépara páginas eliminadas
56
Utilización del cachépara páginas eliminadas
57
Búsqueda selectiva de imágenes
58
(No Transcript)
59
(No Transcript)
60
(No Transcript)
61
(No Transcript)
62
Acceso a traducción on line (limitada en su
calidad)
63
Acceso a traducción on line (limitada en su
calidad)
64
(No Transcript)
65
Traducción
Original
66
Copiado (download) de la información

• Mediante el browser, desde el sitio donde se
  localizó el o los archivos definir bien la
  ubicación, para su localizacion posterior
• Se disminuye el tiempo de copiado mediante
  programas específicos
• www.gozilla.com - www.getright.com -
  www.speedbit.com

67
Guardar direcciones de sitios de
interéslocalizados en la Web

• Favoritos - Bookmarks

68
(No Transcript)
69
(No Transcript)
70
(No Transcript)
71
Los favoritos se pueden copiar en diskettes,
enviar por email, etc.
72
Localización de la información científica

• Se localiza información
• A través de la Web
• accediendo a sitios institucionales y biliotecas
• con programas llamados Buscadores o Searchers
• accediendo a Medline
• accediendo a Bireme-Lilacs

73
Medline

• Base de datos bibliográfica de la National
  Library of Medicine - NLM
• abarca los campos de medicina, enfermería,
  odontología, veterinaria, salud pública y
  ciencias preclínicas o básicas.
• contiene citas bibliográficas y resúmenes de
  aproximadamente 4300 publicaciones biomédicas
  sumando más de 10 millones de citas desde 1966.
• se actualiza mensualmente
• es gratuita
• PubMed ofrece acceso a dos bases de datos
  MEDLINE y PREMEDLINE (datos aún no indexados en
  MEDLINE)
• PubMed se actualiza semanalmente.

74
PubMed - Medline

• Búsquedas simples
• con o sin operadores AND OR NOT
• Utilización de Limits
• acotación de los resultados
• Journal Browser
• para hojear revistas
• Citation Matcher
• ubica trabajos conocidos
• MeSH Browser
• búsquedas avanzadas
• Clinical Queries
• mediante categorías (therapy, diagnosis,
  etiology, prognosis) y elección de sensibilidad y
  especificidad.
• Cubby
• almacenamiento y actualización de búsquedas
  

75
PubMed - Medline

• Habilitar la recepción de cookiesantes de
  comenzar las búsquedas

76
(No Transcript)
77
Búsqueda simple arrhythmia
arrhythmia
78
Arrhythmia 101.249 citas
79
Utilizando operadoresAND OR - NOT
80
Arrhythmia AND ventricular 36.674 citas
Por defecto, si hay más de un término el operador
es AND
81
Si están habilitadas las cookies, History
guardará las búsquedas y las mostrará en orden
cronológico
82
History combinación de búsquedas

• Se utiliza el signo numeral delante del número
  de búsqueda
• 2 AND 6
• 3 AND (drug therapy OR diet therapy).
• Número máximo de búsquedas a almacenar 100
• Duración de la actividad de la cookie ocho horas
• Limpieza de búsquedas
• Clear History

83
Guardado de una búsqueda

• Click en Details
• Clic en URL
• aparecerá la URL (dirección) de la búsqueda
• Guardar en Favoritos o Bookmarks
• No funciona si se utilizó History (pues dura sólo
  ocho horas)

84
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT
sustained 15.608
85
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT
sustained AND 2001 1074
86
Utilización de Limits

• campo de búsqueda (título, autor, etc.)
• grupo etario
• sexo
• humano o animal
• idioma
• disponibilidad de abstracts
• fechas de publicación o de indexación
• tipo de publicación (ensayo clínico clinical
  trial, editorial, etc.)
• Nota la mayoría descartan PREMEDLINE

87
Agregando Limits
88
Resultado con Limits 31 citas
89
Id. anterior, trabajos sólo de 2001 7 citas
Traducción buscar ensayos clínicos que tengan
abstracs, publicados en 2001,sobre tratamiento
en adultos de arritmia ventricular no sostenida.
90
Tipos de artículos

• Clinical Trial
• Editorial
• Letter
• Meta-Analysis
• Practice Guideline
• Randomized Controlled Trial
• Review

91
Subgrupos por edad

• All Infant birth-23 months
• All Child 0-18 years
• All Adult19 years
• Newborn birth-1 month
• Infant 1-23 months
• Preschool Child 2-5 years
• Child 6-12 years
• Adolescent 13-18 years
• Adult 19-44 years
• Middle Aged 45-64 years
• Middle Aged Aged 45 years
• Aged 65 years
• 80 and over 80 years

92
Descripciones de campo y tags

• Affiliation AD datos de contacto
• All Fields ALL búsqueda en todos los campos
• Author AU búsqueda por autor
• Entrez Date EDAT fecha en que ingresó el
  artículo
• Journal Title TA
• Filtro sb
• loallsb citas con liks externos
• free full textsb - citas con full-text
  gratuitos
• full textsb citas a artículos full-text
• Etc., etc...
• Información completa http//www.ncbi.nlm.nih.gov/
  entrez/query/static/help/pmhelp.htmlSearchFieldDe
  scriptionsandTags

93
Búsqueda por autor

• En el campo AUTOR introducir el apellido e
  iniciales, sin puntos ni comas
• smith ja
• jones k
• Si se ingresa sólo apellido se buscará en todos
  los campos, salvo que este dato esté indexado en
  MESH o que se acompañe de au
• Yang encontrará Yin-Yang MeSH o Yang Text
  Word
• Yang au sólo buscará en autores

94
Nombre de publicaciones

• Campo título
• Título completo
• Molecular Biology of the Cell
• Abreviatura de Medline
• mol biol cell
• El número ISSN (código internacional estandard)
• 1059-1524 (ausente en publicaciones antiguas)
• Título según aparece en el catálogo de NLM
• Si hay o ( ) quitarlos
• j hand surg am debe ingresarse j hand surg am
• Exclusivamente títulos ta

95
MeSH Translation Table

• Sistema de traducción automático
• MeSH Terms
• See-Reference mappings for MeSH terms
• MeSH Subheadings
• Publication Types
• Pharmacologic Action terms
• Sinónimos o equivalentes en inglés
• Si el término ingresado tiene un equivalente en
  esta tabla, la búsqueda se hará automáticamente
  en términos MeSH

96
Mapeo automático de términos

• Orden de búsqueda
• MeSH
• Translation Table
• Journals Translation Table
• Author

97
Journals Translation Table

• Sistema automático de traducción de nombres de
  publicaciones
• Ingresando new england journal of medicine se
  hará la búsqueda automáticamente como "N Engl J
  Med"Journal

98
Uso de y de

• Permite búsquedas de troncos de palabras
• card encontrará cardiac, cardiovascular, etc.
• buscan frases exactas.
• Anulan el mapeo automático de términos

99
Subcategorías de Journal/Citation

• Se obtienen mediante el agregado del prefijo
  jsubset y las letras de la subcategoría
• neoplasms AND jsubsete
• E citas o publicaciones sobre bioética
• H Publicaciones de administración de salud
• IM Index Medicus
• N enfermería
• Q historia de la medicina
• S ciencias del espacioT
• X HIV SIDA

100
PubMed Central

• Búsquedas de publicaciones que tienen contenidos
  full text
• Se accede desde PubMed Central o con los
  comandospubmed pmc localsbEjemplo sudden
  death AND pubmed pmc localsb

Publicaciones con abstracts

• Comando hasabstract
• Ejemplo sudden death AND hasabstract

101
Journal Browser

• Herramienta para hojear publicaciones
• Se ingresa el nombre de la publicación, o la
  abreviatura correspondiente de MEDLINE o el
  identificador ISSN.
• Mediante Limits se elige el ejemplar buscado

102
Ingreso del nombre de la publicación
103
Codificación de la publicación
104
Acceso a la totalidad de lo publicado 17.965
citas
105
Utilización de Limits fecha de publicación
106
Utilización de Limits fecha de publicación 55
citas
107
Citation Matcher

• Herramienta para buscar artículos cuando se
  dispone de la cita
• Se ingresan los datos conocidos en los diferentes
  campos

108
Cuando se conoce la cita bibliográfica
109
Cuando se conoce la cita bibliográfica
110
Obtención directa cuando se conoce la cita
bibliográfica
111
Abstract del artículo
Búsqueda de artículos que contengan en el título,
abstract o en MeSH palabras correspondientes,
seleccionadas mediante un poderoso
algoritmo. Posee opciones, incluyendo
combinaciones con búsquedas 3 AND englishla
Books y LinkOut rescatan abstracts de libros y
links a sitios Webs relacionados
112
MeSH Browser - Encabezados de Temas Médicos

• Herramienta de mayor complejidad y eficacia
  aplica la lógica que utilizan los bibliotecarios.
• Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de
  datos de PubMed es indexada con los Medical
  Subject Headings (o MeSH) que describen el tema
  contenido en el artículo.
• El MeSH Browser permite la búsqueda de citas por
  términos MeSH.
• Los términos MeSH se dividen en encabezados y
  subencabezados

113
MeSH Browser (actualmente Mesh Database con
algunas diferencias)
114
Buscar el término MeSH
115
Muestra los términos que tiene indexados
116
Verificar el árbol y agregarlo (Add) a la
búsqueda
117
Buscar subencabezados o subtérminos MeSH
118
Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez
119
Realizar la búsqueda en PubMed
120
Incluir límites si son necesarios
121
Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)
122
Opción de guardar la búsqueda MeSH
123
Guardado de la búsqueda como Favoritos o
Bookmarks
124
Ej. Inmunología en la Enfermedad de Chagas
congénita

• Optar por "MeSH Browser"
• Escribir en "Search for" el término a buscar
  (Chagas) y hacer clic en "Go"
• Elegir en el listado el término MeSH más adecuado
  (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this
  term"
• Aparece un árbol de categorías MeSH relacionadas
  con el término a buscar.
• Hacer clic en "Add this term to the Search using
  operator AND"
• Aparece en la nueva ventana "Chagas
  Disease"MESH
• Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a
  uno por vez, los términos/subtítulos MeSH
  necesarios para acotar la búsqueda
• Hacer clic en "PubMed Search"
• Si es necesario, incluir "Limitsy/o Add Terms

125
Búsqueda compleja
126
Búsqueda compleja
127
Búsqueda compleja
128
Traducción de una búsqueda compleja

• ((((((Hypertension/drug therapyMESH AND
  Clinical Trialptyp) AND EnglishLang) AND
  "adult"MeSH Terms) AND "human"MeSH Terms) AND
  ("2001/02/16 01.46"EDat "2001/03/18
  01.46"EDat)) AND ("2001/02/16"EDat
  "2001/03/17"EDat))
• Esta sería la traducción aproximada
• "Buscar trabajos de marzo de 2001, sólo escritos
  en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en
  humanos, mayores de 19 años, sobre el tema
  terapia con drogas de la hipertensión arterial
  

129

• Clinical Queries
• Filtros de categorías, sensibilidad y
  especificidad

130
Filtros de categorías, de sensibilidad y de
especificidad
131

• Cubby
• Almacenamiento y actualización de búsquedas

132
Almacenamiento y actualización de búsquedas
133
Registro en Cubby

• Nombre de usuario (3-10 caracteres alfanuméricos)
  
• Contraseña (6-8 caracteres alfanuméricos)
• Recordatorio Nombre de soltera de la madre o
  nombre de una mascota, etc., etc.
• Anotar cuidadosamente importan mayúsculas y
  minúsculas
• El login dura 12 horas (necesita que estén
  activadas las cookies)

134
PubMed - Medline

• Técnicas
• Búsquedas simples
• Utilización de Limits
• Journal Browser
• Citation Matcher
• MeSH Browser
• Clinical Queries
• Cubby
• El material de texto completo (full text) puede
  ser obtenido en forma gratuita o bajo un arancel.
• Esto es sólo la técnica para la búsqueda de
  información en Pubmed hay que profundizar en la
  estrategia.

135
(No Transcript)
136
Si hay dudas con la ortografía inglesa de los
términos a buscar
137
Se escribe en castellano y se traducen los
términos MeSH a inglés
138
Aparecen jerarquías, términos y subtérminos
139
Se eligen las opciones
140
Localización de la información científica

• Se localiza información
• A través de la Web
• accediendo a sitios institucionales y bibliotecas
  
• con programas llamados Buscadores o Searchers
• accediendo a Medline
• accediendo a Bireme-Lilacs

141
BIREME-LILACS Medline LatinoamericanaHerrami
entas similares a PubMedIdiomas castellano,
portugués e inglés
142
Información general
143
Límites
144
Páginas de ayuda
145
Páginas de ayuda
146
Similar a metodología MESH
147
(No Transcript)
148
Categorías y subcategorías
149
Categorías y subcategorías
150
Conceptos básicos finales (para no
marearse)Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso
Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001

• Planificar una estrategia
• No sentarse a la PC sin un plan
• escribir antes la búsqueda,
• que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada
• abrir un solo frente por vez y agotarlo
• si se encuentra un buen trabajo, detenerse y
  leerlo ... al otro día se hará una mejor
  búsqueda
• escribir todo en inglés (ayudarse con un buen
  diccionario y/o con HonSelect).
• No es difícil, pero hay que sumar horas de
  silla.

151
Direcciones de Internet citadas en la exposición

• www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/fig910.htm
• www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/atennecr.htm
• www.annals.org/issues/v134n12/toc.html
• www.fac.org.ar
• www.fac.org.ar/cvirtual/cvirteng/cienteng/mneng/mn
  m3004i/dicarli/dicarli.htm
• www.acc.org
• www.asecho.org
• www.americanheart.org
• www.worldheart.org
• www.who.int
• www.who.int/regions/amro
• www.paho.org
• www.cochrane.org
• www.hon.ch
• www.hon.ch/MedHunt
• www.bireme.br/bvs/E/ehome.htm
• www.uba.ar
• www.un.edu.ar
• http//www.unl.edu.ar

• www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
• http//www.fac.org.ar/publico.htm
• cursofac_at_fac.org.arwww.fac.org.ar/fec/cursofac
• www.fac.org.ar/fec/cursofac
• www.fac.org.ar/fec/cursofac/fmsfe04
• www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?cursofac736
• www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?chagas-pcvc679
  
• www.fac.org.ar/ccvc
• www.fac.org.ar/tcvc
• www.fac.org.ar/scvc
• www.fac.org.ar/cvirtual
• http//vercorreo.com
• http//cardiofellows.mc.duke.edu
• http//dukecardiology.duke.edu/home.asp?divisionID
  39
• http//www.centerwatch.com/patient/studies/area1.h
  tml
• http//www.nhlbi.nih.gov/guidelines/hypertension/j
  ncintro.htm
• http//www.ccs.ca/society/conferences/index.cfm
• http//www.cardiology.med.ucla.edu/Cardiology/home
  .htm
• http//www.mecme.org/