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ESTUDIO PROSPECTIVO DE FORMAS GENETICAS NO-B DEL
VIH-1 EN PACIENTES PROCEDENTES DEL PAIS VASCO
ALTA DIVERSIDAD GENÉTICA Y PREDOMINIO DE FORMAS
RECOMBINANTES. María Teresa Cuevas
González-Nicolás1, Elena Delgado Blanco1, Miguel
Thomson Okatsu1, Aurora Fernández-García 1,
Mercedes Muñoz-Nieto1, Ester Serrano Bengoechea2,
Ana María Sánchez Sánchez1, Carmen Ezpeleta
Baquedano3, María González-Galeano1, Leyre López
Soria4, Milagros Pinilla García1, María Jesús
Lezaún5, Valentina García Álvarez1, Labora A6,
Pérez-Alvarez L1, y el grupo Español de Estudio
de Resistencias a Antiretrovirales en el País
Vasco. 1Unidad de Biología y Variabilidad de VIH.
CNM. Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda.
Madrid. 2 Complejo Hospitalario Donostia, San
Sebastían, Guipuzcoa. 3Hospital de Basurto,
Bilbao. 4Hospital de Cruces, Baracaldo, Bilbao.
5Hospital de Txagorritxu, Vitoria, Alava.
6Hospital de Santiago Apostol, Vitoria, Alava.
NUMERO DE POSTER P 49
Objectivo El objeto de este trabajo fue analizar
la introducción y expansión de formas virales
no-B en el País Vasco, desde el año 2002 hasta
Abril del 2009. Pacientes y Métodos Se
incluyeron un total de 1.900 pacientes que
estaban siendo atendidos en 9 hospitales del
servicio público de salud del País Vasco entre
los años 2002 hasta Abril del 2009. El ARN se
extrajo a partir de plasma, se amplifico la
región de pol correspondiente a Proteasa y
Transcriptasa inversa (PR-RT) mediante RT-PCR
para su posterior secuenciación. Las secuencias
se ensamblaron usando el programa Seqman
(DNASTAR), y se corrigieron con Bioedit
(www.mbio.ncsu.eduBioeditBioedit.html). Para
definir el subtipo viral, se realizaron árboles
filogenéticos el programa MEGA (Molecular
Evolutionary Genetic Analysis), siguiendo el
método de unión por vecindad (Neighbour
joining), se realizaron 100 réplicas en la
construcción de estos árboles, considerando un
valor de bootstrap significativo igual o superior
al 70. Las secuencias también se analizaron
enviándolas online al programa Rega de la
universidad de Stanford (http//dbpartners.stanfor
d.edu/Regasubtyping) y al Genotyping
(http//www.ncbi.nlm.nih.gov/ projects/
genotyping). La recombinación se analizó en mayor
detalle mediante bootscanning usando el programa
Simplot (http//sray.med.som.jhmi.edu/RaySoft/sim
plot.html) y con otro programa de la base de
datos de los Alamos, jpHMM (jumping profileden
Markov Model (http//jphmm.gobics.de)
Introducción El VIH muestra una alta diversidad
genética, debido principalmente a la alta tasa de
replicación, a los errores que comete la
transcriptasa inversa al sintetizar el ADN
proviral y a su capacidad de recombinación. Estas
características virales ha permitido la
clasificación del grupo M en nueve subtipos A,
B, C, D, F, G, H, J, K. Las secuencias de los
subtipos A y F muestran una cierta divergencia,
por lo que se han descrito sub-subtipos, A1-A4 y
F1-F2. En áreas donde co-circulan diferentes
subtipos se han descrito virus recombinantes. Si
los virus presentan el mismo patrón de
recombinación y se detectan en 3 ó mas pacientes
no relacionados epidemiológicamente se definen
como formas circulantes recombinantes, en inglés
CRF. Hasta ahora se han descrito 43 CRF. Al resto
de los virus recombinantes se les define como
formas recombinates únicas o URF. En España la
forma viral más prevalente es el subtipo B, si
bien los movimientos poblacionales han permitido
la introducción y expansión de virus de subtipo
no-B.
RESULTADOS
3.- VÍA DE TRANMISIÓN La mayoría de los
pacientes (83.2) se infectaron por vía sexual,
incluyendo 134 (70.2) pacientes cuya infección
fue por vía heterosexual, 13 (6.8) se produjo
entre hombres homo o bisexuales, hubo 12 casos
entre varones que definieron su vía de contagio
como sexual sin especificar si fue homo ó
heterosexual y por último 21 (10.9) pacientes se
infectaron por el uso de drogas inyectables.
2.- ORIGEN DE LOS PACIENTES 57 (29.8) pacientes
procedían de España, 92 (48.2) de África, 19
(9.9) de América, 17 (8.9) de otros países
europeos, 1 de Asia y en 5 casos no tuvimos datos
del país de origen de los pacientes.
1.-VIRUS DE SUBTIPO NO-B Un total de 191
(10.1) pacientes se infectaron con virus de
subtipo no-B. Se observó un incremento anual en
la frecuencia de este tipo de virus 5,2 en
2002, 2,1 en 2003, 9,4 en 2004, 7,8 en 2005,
11,5 en 2006, 17,8 en 2007, 34,1 en 2008, 12,
1 de Enero a Abril de 2009, es importante
destacar que aunque son sólo cuatro meses el
porcentaje es superior a los valores obtenidos
previos al 2007 .
6.-PATRON DE LOS MOSAICOS DE RECOMBINACION II
4.-ARBOL FILOGENÉTICO
5.-DISTRIBUCIÓN DE LAS FORMAS GENETICAS DEL VIH
P1915
La distribución de las formas genéticas presentó
una predominancia de formas recombinantes
(61,3), incluyendo 86 (45,1) CRFs, y 31 (16,2)
URFs. La CRF02_AG fue la forma genética más
frecuentemente detectada (83.7), seguida de 5
CRF14_BG, 2 CRF01_AE, 2 CRF11_cpx, 2 CRF12_BF, 1
CRF13_cpx, 1 CRF19_cpx y 1 CRF28_BF. Respecto a
las URFs, 20 (64.5) de ellas fueron
recombinantes donde estaban implicados dos
subtipos y 11 (35.5) donde estaban implicadas,
bien una CRF y un subtipo, o dos CRFs. Destacamos
la presencia de 6 secuencias recombinantes en las
que estaban implicadas las CRF02_AG y CRF06_cpx.
Por último, 73 (38.2) muestras agruparon con
subtipos, siendo los subtipos G y C los más
prevalentes (30.1) cada uno de ellos, seguidos
de los subtipos F (19.1) y A (13.7). Otros
subtipos detectados fueron 2 D, 1 A2, 1 F2 y 1
H. Una secuencia se definió como U
(unclassified), al no poderse tipar Es importante
destacar que aunque la proporción entre hombres y
mujeres fue muy similar (51.3 vs. 47.1), el
porcentaje de hombres fue superior entre los
afectados por los subtipos C, G y CRF14_BG,
mientras que la proporción de mujeres fue
superior entre los pacientes infectados por
subtipos F1 y CRF02_AG.
P0846

6.-PATRON DE LOS MOSAICOS DE RECOMBINACION I Se
muestran algunos de los patrones de recombinación.
P1273
P1813
CONCLUSIONES Describimos una gran diversidad
viral del VIH-1 en pacientes procedentes del País
Vasco. El incremento en el número de formas
virales no-B a lo largo de los años, está dando
lugar a la generación y circulación de
recombinantes nuevos y más complejos.
P0846
P1842
AGRADECIMIENTOS Agradecemos al Dr. Daniel
Zulaica, coordinador del Plan para la prevención
y control del Sida y al personal del servicio
Vasco de Salud- Osakidetza, por su apoyo y
colaboración en el desarrollo de este trabajo. El
grupo Español de Estudios de Resistencias a
Antiretrovirales en el País Vasco Álava H.
Txagorritxu Agud JM, Aldamiz M, Ayensa C,
Barroso J, Lezaun MJ, Michaus L, Pérez-Ortola R,
and Portu JJ. H. de Santiago Andia A, Labora A.
Guipuzcoa Complejo Hospitalario Donostia
Arrizabalaga J, Cilla G, Echevarria J, Iribarren
JA, Rodriguez-Arrondo F, Serrano-Bengoechea E and
Von Wichmann MA, H de Zumarraga Bustillo MA.
Vizcaya. H Galdakano López de Goichoechea M, H
de Cruces Aguirrebengoa K, López Soria L,
Goikoetxea J, Montejo M, Bereciartua E. H
Basurto Baraia JB, Cisterna R, Ezpeleta C,
Ferrero O, Ibarra S, Imaz M, Muñoz-Sanchez J,
Santamaría JM, Sota M, Zubero Z, H San Eloy
Lizarraga M, Silvariño R.