Infra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidade Vanderlei Perez Canhos [e-mail] www.cria.org.br Cole

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Infra-estrutura compartilhada de dados sobre
biodiversidadeVanderlei Perez
Canhosvcanhos_at_cria.org.brwww.cria.org.brColeçõ
es Biológicas e Sistemas de InformaçãoBrasilia,
DF, Julho de 2005
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ação
conhecimento
informação
Desafio ampliaçao do uso de dados científicos
sobre biodiversidade
dados
observações
mundo real
3
Marco Legal A Convenção sobre Diversidade
Biológica

• Clearing-House Mechanism
• - Intercâmbio de informação e cooperação técnica
• 2010 Biodiversity Target
• Redução da taxa de perda de espécies depende de
  dados sobre a ocorrência de espécies
• Global Taxonomy Initiative
• Definição do ponto focal nacional e estratégias
• International Pollinators Initiative
• Iniciativa do Brasil coletas, taxonomia,
  checklists
• Global Strategy for Plant Conservation
• Objetivo conter a perda da diversidade de
  plantas
• Objetivo específico compreender e documentar a
  diversidade de plantas

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Sistemas de Informação cenário internacional

• GBIF Global Biodiversity Information Facility
• IABIN Inter-American Biodiversity Information
  Network
• Catálogo da Vida (Species 2000, ITIS)
• Conabio (Remib)
• IIAP (Siamazonia)
• INBio
• NYBG (repatriação)

5
Cenário Nacional MCT programas

• PROANTAR, PPG7, Revizee, Institutos do Milênio,
  Xingó, ... todos geradores de dados e informações
  - falta uma política para coleções de dados
• Inexistência de um sistema de avaliação coletiva
  dos projetos que envolvem a geração de dados e
  informações
• Inexistência de uma estratégia inter-agências
  explícita visando estruturar uma rede de dados e
  informações de acesso público
• Inexistência de uma política de disponibilização
  e compartilhamento dos resultados das pesquisas
  financiadas pelo MCT
• Necessidade de política para a recuperação de
  acervos históricos e de preservação e
  disseminação dos dados que já nascem digitais
• Recomendação MCT desenvolva uma estratégia
  explícita para o desenvolvimento e manutenção de
  uma infra-estrutura de dados científicos para o
  país

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True bioinformatics
7
Serviços Web tornam possível a integração de
dados estruturados
Serviços Web
Bancos de dados heterogêneos
Dados Padronizados e Estruturados
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Interoperabilidade entre sistemas de informação
Com os desenvolvimentos recentes catalisados pelo
GBIF, dados de fontes distribuidas podem ser
integrados através de única busca.
Informação compilada sobre espécimens, genética e
ecologia
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Global Biodiversity Information Facity (GBIF)
Provedores de informação
Portal de Acesso a dados sobre Biodiversidade
Índice de Dados sobre Biodiversidade
Catálogo da Vida
Serviço de nomes taxonô-micos
10
(No Transcript)
11
Dados sobre biodiversidade
12
Instituto Virtual da Biodiversidade-Biota FAPESP
(Março 1998)

• Estudar e conhecer a biodiversidade do Estado de
  São Paulo e divulgar este conhecimento e sua
  importância
• Ampliar a capacidade das organizações públicas e
  privadas no gerenciamento, monitoramento e
  utilização da biodiversidade
• Subsidiar a tomada de decisão sobre projetos de
  desenvolvimento, especialmente os de
  desenvolvimento sustentável

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Sistemas de Informação de apoio ao programa
Biota/Fapesp

• SinBiota
• Revista Biota Neotropica
• Rede speciesLink

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acacia glomerosa
pyrostegia
15
Integração
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speciesLink uma rede de informação que permite a
integração dinâmica, síntese e visualização de
dados primários de coleções biológicas http//spli
nk.cria.org.br
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• integração dinâmica de dados distribuídos
• software livre e de código aberto
• equipamentos de baixo custo
• integra sistemas diversos de gerenciamento de
  coleções (sistema operacional, software,...)
• integra de dados de diferentes grupos taxonômicos
• rede integrada com outros sistemas e redes de
  informação (SinBiota, SICol, Species Analyst,
  GBIF)

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Herbário do Instituto de Biociências, UNESP Rio
Claro
Coleção de Microrganismos de Ambiente e
Indústria, UNICAMP Campinas
B
M
SinBiota Sistema de Informação Ambiental do
Programa Biota - Fapesp
M ZB
Coleção de Anfíbios do Instituto de
Biociências UNESP, Rio Claro
Herbário do Instituto Agronômico de Campinas
Z
B
Herbário da UNICAMP, Campinas
B
Col. Culturas de Fitobactérias Lab. De
Bacteriologia Vegetal Instituto
Biológico, Campinas
M
Servidor Regional
Coleção de Acari Museu de Zoologia, ESALQ,
Piracicaba
Z
Herbário do Jardim Botânico do Rio de Janeiro
B
Herbário do Departamento De Ciências Biológicas
da ESALQ, Piracicaba
B
Coleção de Peixes do Laboratório de Ictiologia,
USP, Ribeirão Preto
Z
Servidor Regional
Herbário da USP, São Paulo
B
Coleção de Peixes Dept. Zoologia e Botânica,
UNESP, São José do Rio Preto
Z
Coleção de Peixes Museu de Zoologia da USP, São
Paulo
Z
Servidor Regional
Servidor Regional
Coleção de Fungos Instituto de Botânica, São Paulo
M
Coleção de Acari Dept. Zoologia e Botânica,
UNESP, São José do Rio Preto
Z
Coleção de Algas Instituto de Botânica, São Paulo
B
Coleção de Anfíbios Dept. Zoologia e Botânica,
UNESP, São José do Rio Preto
Z
Servidor Regional
Coleção de Fanerógamas Herbário do Instituto de
Botânica, São Paulo
B
Servidor Regional
Herbário Dom Bento Pickel do Instituto
Florestal, São Paulo
B
Coleção de Quirópteros Dept. Zoologia e Botânica,
UNESP, São José do Rio Preto
Z
Herbário de Ilha Solteira, UNESP Ilha Solteira
B
Herbário do Instituto de Biociências,
UNESP, Botucatu
B
Coleção Científica de Aranhas do Dept. Zoologia
e Botânica, UNESP, Botucatu
Coleção do Museu de Entomologia da
FEIS/UNESP Ilha Solteira
Z
Z
19
Construção da infra-estrutura compartilhada de
dados
é um esforço coletivo.....
20
localidades amostradas
temperatura
precipitação
topografia
distribuição potencial
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Byrsonima subterranea
Somente um registro de ocorrência Inclusão na
lista de espécies ameaçadas do Estado de São
Paulo (1999) Novo registro de ocorrência na
Estação Ecológica de Assis Uso da modelagem
para auxiliar na localização da espécie
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Classificação do Solo Similaridade Ecológica
Manchas de Cerrado
23
Validação do modelo no campo
24
Previsão de riqueza (cenário atual) para 162
espécies de árvores do Cerrado
Previsão de distribuição de Acosmium subelegans
no presente e no futuro (2055)
Área habitável em 2055 ( 0,5 CO2)
Área habitável em 2055 (1 CO2)
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Áreas prioritárias para conservação da
Biodiversidade do Cerrado e do Pantanal
Conservation International do Brasil 1998
As áreas circunscritas em azul e rosa
correspondem as regiões mais indicadas para
conservação segundo critérios baseados nas
projeções climáticas futuras
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Redes Temáticas
Outras Floras Regionais
Outros Herbários na Internet
Flora brasiliensis
Checklist

• Aplicativos
• Modelagem preditiva
• Protocolos de interoperabilidade
• Servidor de nome
• Servidor de localidades
• Banco de imagens
• Bancos de dados primários (pesquisa)
• Guias de campo dinâmicos
• Chaves interativas

Herbário Virtual
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Resultado Esperado Croton urucurana
Dados Históricos
28
Exsicata em Herbário
29
Imagem no campo
30
Croton urucurana
31

• Gestão da Informação

Gestão Ambiental
Obrigado Vanderlei Perez Canhos (vcanhos_at_cria.or
g.br