Prote

1
Proteómica
2
Cómo abordamos el estudio y comprensión de un
sistema biológico?
3
Genoma representación estatica de una sistema
biológico.
4
A partir de la secuencia del DNA no se puede
predecir

1. Si y cuándo un RNA se traduce.
2. La concentración relativa de productos génicos.
3. Modificaciones postraduccionales.
4. Represiones y sobreexpresiones génicas.
5. Fenotipos resultantes de la actuación de
   múltiples genes.

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La proteómica plantea objetivos complementarios

• Sistemático estudio global de la expresión
  proteica, es decir, identificación de todas las
  proteínas en referencia a un estado fisiológico
  determinado.
• Pragmático propone comparar la expresión
  proteíca de dos situaciones fisiológicas y
  establecer mapas bidimensionales.

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Aplicación

• Sistemático. Analizar
• Modificaciones postraduccionales.
• Localización subcelular.
• Interacción con otras moléculas.
• Estado fisiológico de la toma de muestra.
• Pragmático. Estudios de expresión diferencial de
  proteínas en diferentes estados fisiológicos
• Medicina.
• Toxicología.
• Farmacología.

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Cómo se caracteriza una mezcla proteica?

• SEPARAR LAS PROTEÍNAS
• Preparar la muestra.
• Tecnicas de separación
• Cromatografía.
• Electroforesis 2D.
• MEDIR ALGUNA PROPIEDAD INTRINSECA
• Masa, espectrometría de masas.
• COMPARACIÓN CON BASES DE DATOS.
• PMF Peptide Mass Fingerprinting.

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Isoelectroenfoque
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Electroforesis bidimensional
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Mas de 1000 proteínas de E. coli
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Geles bidimensionales
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(No Transcript)
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Espectrómetro de masas
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ICAT
15
Identificación y caracterización de proteínas por
espectrometría de masas
16
Identificación y caracterización de proteínas por
espectrometría de masas