Title: Service de Bactriologie Dpartement des Maladies infectieuses et parasitaires Facult de Mdecine Vtrin
1Service de BactériologieDépartement des Maladies
infectieuses et parasitairesFaculté de Médecine
Vétérinaire
Cours de bactériologie 3ème candidature
- Chapitre 6
- Les grands groupes bactériens
2Les grands groupes bactériens
- Taxonomie
- Nomenclature
- Systématique des groupes dintérêt médical
3Les grands groupes bactériens
- morphologie
- coloration
- biochimie
- moléculaire - chaînes métaboliques
- - enzymes respiratoires
- - membranes externes
- - génétique ADN et ARNr
4Les grands groupes bactériens
- Taxonomie critères actuels
5Les grands groupes bactériens
- Taxonomie ne tirez pas sur le pianiste !
- Ce nest pas le bactériologiste qui samuse
- à rendre le monde bactérien complexe
- mais ce dernier qui, petit à petit,
- révèle sa complexité au bactériologiste
6Les grands groupes bactériens
Origine - homme célèbre -
morphologie - culture
- biochimie - géographie
- pathologie
7Les grands groupes bactériens
Famille M-aceae
Alcaligenaceae
8Les grands groupes bactériens
- Nomenclature au-delà de lespèce
Biotype (Biovar) Brucella melitensis, B. abortus
et B. suis comprennent 3, 7 et 5
biotypes Sérotype (Sérovar) Salmonella enterica
sérovar Typhimurium Leptospira interrogans
sérotype Icterohaemorrhagiae Escherichia coli
O101 K30 H- F5 Streptococcus canis groupe
G Les espèces du genre Brucella sont subdivisées
en sérotypes A, M ou R Lysotype
(Lysovar) Brucella abortus lysovar
Tbilissi Salmonella enterica sérovar Typhimurium
DT104 Pathotype (Pathovar) Escherichia coli
entérotoxinogènes STa F5 (diarrhée
veau) Escherichia coli vérotoxinogènes Stx2e
F18 (maladie dème porcelet)
9Les grands groupes bactériens
- 3. Systématique des groupes dintérêt médical
Plan
- Coques Gram
- catalase catalase
- Bâtonnets Gram
- - petits réguliers petits irréguliers ramifiés
grands réguliers - Gram sans paroi
- - les mollicutes
- Coccobacilles et bacilles Gram- poussant sur
Gassner - - oxydase- O/FF oxydase O/FO oxydase
O/FF oxydase O/F- - Coccobacilles et bacilles Gram- ne poussant pas
sur Gassner - - aéroanaérobies métabolisme R F aérobies
métabolisme R microaérobies métabolisme R
anaérobies facultatives métabolisme F anaérobies
strictes métabolisme R - Bactéries Gram- spiralées
- - aérobies microaérobies anaérobies non
cultivables - Bactéries Gram- intracellulaires obligées
- - avec ou sans hôtes intermédiaires
10Gram
Aerococcus Stomatococcus oxydase
11Les grands groupes bactériens GRAM
A. Définition
Coques (0,5 1,5 µm)
mobilité - spores -
test O/F F
12Les grands groupes bactériens GRAM
B. Biologie
- saprophytes eau, air, sols, animaux
- peau, nasopharynx,
génital, intestin (lait) - ou résistant aux conditions extérieures
- pathogènes opportunistes suppuration et abcès
superficiels et profonds, mammites, rhinites,
troubles digestifs (genre Enterococcus)
POUR LES TRAVAUX PRATIQUES
hémolyse ß (simple / double)
hémolyses a, ß, ?
sérotypie (groupes de Lancefield A à V)
13Les grands groupes bactériens GRAM
14Les grands groupes bactériens GRAM
C. Importance médicale au niveau des denrées
alimentaires
- Staphylococcus aureus, intermedius, hyicus,
epidermidis
- Enterococcus sp. indicateur de contamination
fécale des aliments
15Les grands groupes bactériens GRAM
- Enterococcus sp., Lactococcus sp., Leuconostoc
sp., Pediococcus sp., Streptococcus sp.,
famille Streptococcaceae
16- - Listeria aéroanaérobie, catalase
- Erysipelothrix anaérobie facultative, catalase -
- Renibacterium aéroanaérobie, catalase
- Lactobacillus, Carnobacterium
- technologie DAOA
- - Corynebacterium aéroanaérobie, catalase
- - Rhodococcus aéroanaérobie, catalase
- Arcanobacterium anaérobie facultative, catalase
- - Actinobaculum anaérobie stricte, catalase -
- Brevibacterium, Propionobacterium
- technologie DAOA
17Les grands groupes bactériens GRAM
A. Définition
petits bâtonnets réguliers
(0,5 x 1,0-2,0 µm)
(0,2 x 1,0-2,0 µm)
(0,3-1,0 x 1,0-1,5 µm)
aéroanaérobies
anaérobies facultatives
aéroanaérobies
catalase
catalase -
catalase
mobilité -
(mobilité à 25C)
spores -
métabolisme RF
métabolisme F
métabolisme RF
test O/F F
amas intraleucocytaires filaments
18Les grands groupes bactériens GRAM
B. Biologie
Listériose Rouget Bacterial
Kidney Disease Troubles nerveux, Septicémie,
arthrose, Néphrite granumolateuse avortements
dermatite
19Les grands groupes bactériens GRAM
- Listeria monocytogenes
- BB, OV
- Listeria ivanovii
- OV, rongeurs, homme
- Renibacterium salmoninarum
- salmonidés
20Les grands groupes bactériens GRAM
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Listeria monocytogenes lait, fromage, plats
semi-préparés,
21Les grands groupes bactériens GRAM
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Erysipelothrix rhusiopathiae
22Les grands groupes bactériens GRAM
Carnobacterium Lactobacillus
D. Autres genres dintérêt technologique
- Carnobacterium spp
- Lactobacillus spp
Certaines espèces sont testées/utilisées comme
probiotiques dans les aliments, voire chez
lanimal
23- - Listeria aéroanaérobie, catalase
- - Erysipelothrix anaérobie facultative, catalase
- - Lactobacillus, Carnobacterium
- technologie DAOA
- - Corynebacterium aéroanaérobie, catalase
- - Rhodococcus aéroanaérobie, catalase
- Arcanobacterium anaérobie facultative, catalase
- - Actinobaculum anaérobie stricte, catalase -
- Brevibacterium, Propionobacterium
- technologie DAOA
24Les grands groupes bactériens GRAM
A. Définition
petits bâtonnets irréguliers CORYNEFORMES
mobilité - spores -
Rhodococus filaments ramifiés
25Les grands groupes bactériens GRAM
B. Biologie
- saprophytes animaux
- peau, tractus urogénital
26Les grands groupes bactériens GRAM
- Arc. pyogenes BB, PC
- Act. suis PC
27Les grands groupes bactériens GRAM
Propionobacterium Brevibacterium
D. Autres genres dintérêt technologique
- Propionobacterium spp
- Brevibacterium linens
28- Dermatophilus anaérobie, catalase -
- Actinomyces anaérobie, catalase -
- - Mycobacterium aérobie stricte, catalase
- Nocardia aérobie stricte, catalase
- Bifidobacterium technologie DAOA
- Bacillus aérobies ou aéroanaérobies, catalase
- Clostridium anaérobies strictes, catalase -
29Les grands groupes bactériens GRAM
Dermatophilus
Actinomyces
A. Définition
bactéries coccoïdes (1 mm) association en
streptocoques branchés
petits bâtonnets corynéformes
cocciforme streptoccociforme
branchements séparation
catalase -
mobilité -
mobilité
spores -
métabolisme F
O/F NA
30Les grands groupes bactériens GRAM
Dermatophilus
Actinomyces
B. Biologie
31Les grands groupes bactériens GRAM
Dermatophilus
Actinomyces
- D. congolensis toutes sauf PC
- Strawberry foot rot
- Lumpy wool OV
- Dermatite mycotique
- Streptothricose BB
- Dermatite mycotique CV
- Act. bovis BB
- Act. suis PC
- Act. viscosus CN
- Act. hordeovulneris
- Act. israeli HO
32Les grands groupes bactériens GRAM
Mycobacterium
Nocardia
A. Définition
aérobies catalase mobilité - spores
métabolisme R (test O/F O ou -)
33Les grands groupes bactériens GRAM
Mycobacterium
Nocardia
B. Biologie
- Saprophytes des sols, de lair, des eaux,
- Parasites des animaux
- peau, muqueuses
Pathogènes intra-cellulaires facultatifs
- nocardiose troubles cutanés,
- respiratoires et mammaires
- tuberculoses troubles variables -
paratuberculose troubles digestifs
34Les grands groupes bactériens GRAM
Mycobacterium
Nocardia
- Myc. bovis BB
- tuberculosis HO (CN, CT)
- capri chèvre
- Myc. avium subsp. avium aviaire
- avium subsp. paratuberculosis BB
, OV - genanense psittacidés
- Myc. leprae HO
- Mycobacterium sp. toutes
- (tuberculose atypique)
- Myc. marinum, fortuitum, chelonae
- poissons
- Nocardia asteroides
- CN, BB, poissons
35Les grands groupes bactériens GRAM
Mycobacterium
Nocardia
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
36Les grands groupes bactériens GRAM
Bifidobacterium
D. Autre genre dintérêt technologique
Certaines espèces sont testées/utilisées comme
probiotiques dans les aliments
37- Dermatophilus anaérobie, catalase -
- Actinomyces anaérobie, catalase -
- - Mycobacterium aérobie stricte, catalase
- Nocardia aérobie stricte, catalase
- Bifidobacterium technologie DAOA
- Bacillus aérobies ou aéroanaérobies, catalase
- Clostridium anaérobies strictes, catalase -
38Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
Clostridium
A. Définition
grands bâtonnets réguliers (0,5 1,0 x 2,5
20 µm)
mobilité ou spores
- isolés, en paires, en chaînes de longueur
variable - bactéries sporulantes
39Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
Clostridium
Coloration de Ziehl-Neelsen modifiée pour
spores Résistances mécaniques, physiques,
chimiques et biologiques
40Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
Clostridium
B. Biologie
Myosites ( charbons bactérien et
parabactérien) Gangrène (gazeuse) Tétanos,
botulisme Entérites/entérotoxémies/abomasite Hépat
ites
Septicémie ( charbon bactéridien ou
anthrax) Mammites Loques des abeilles (couvin)
41Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
- Bac. anthracis TOUS charbon bactéridien
- Bac. cereus BB mammites
- Paenibacillus larvae Abeilles loque américaine
- Melissococcus plutonius Abeilles loque européenne
42Les grands groupes bactériens GRAM
Clostridium
- Cl. chauvoei BB charbon bactérien
- Cl. septicum Tous charbon parabactérien,
abomasite, - gangrène gazeuse, dermatite
- Cl. perfringens Tous entérites, entérotoxémies,
gangrène - Cl. novyi OV (BB) hépatite, gangrène
- Cl. haemolyticum BB hépatite
- Cl. sordellii Ruminants entérites,
entérotoxémies - Cl. spiriforme Lapins entérites, entérotoxémies
- Cl. piliforme CV, CN, CT, hépatite, entérite,
myocardite - rongeurs
- Cl. difficile HO (animaux) entérites
- Cl. colinum oiseaux entérite, hépatite
- Cl. tetani Tous paralysie spastique (tétanos)
- Cl. botulinum Tous paralysie flasque
(botulisme) - Cl. argentinense
43Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
Clostridium
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Bac. cereus, subtilis (thurigiensis dans une
moindre mesure)
44Les grands groupes bactériens GRAM
Bacillus
Clostridium
D. Altération des denrées alimentaires (goût,
couleur, odeur,)
Exemple 1 Al. acidoterrestris
dégradation des produits (jus de fruits)
goût médicamenteux odeur désagréable
Exemple 2 Cl. tyrobutyricum gonflement des
fromages dû à la production de gaz (H2) odeur
et goût désagréables (acide butyrique)
45Les grands groupes bactériens GRAM
Groupe des Mollicutes bactéries sans paroi (
les mycoplasmes)
CLASSIFICATION
4 ordres Mycoplasmatales, Entomoplasmatales,
Acholeplasmatales, Anaeroplasmatales
5 familles Mycoplasmataceae, Entomoplasmataceae,
Spiroplasmataceae, Acholeplasmataceae,
Anaeroplasmataceae
8 genres Mycoplasma, Ureaplasma, Entomoplasma,
Mesoplasma, Spiroplasma, Acholeplasma,
Anaeroplasma, Asteroplasma
gt200 espèces certaines des genres Mycoplasma
(surtout), Ureaplasma et Acholeplasma peuvent
être pathogènes pour les animaux ou lhomme
46Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
A. Définition
47Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
B. Biologie
- Parasites obligés des organismes supérieurs
(animaux, plantes), car ils possèdent peu
dinformation génétique et donc de capacités de
synthèses - La plupart des espèces sont saprophytes
- Quelques espèces sont pathogènes opportunistes
ou primaires - Résistance faible à moyenne dans le milieu
extérieur - b-lactamesR, bacitracineR, sulfamidésR
48Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
- Mycoplasma BB
- mycoides subsp mycoides SC Pleuropneumonie
contagieuse - sp. bovine group 7 Pneumonie, arthrites
- bovis Pneumonies, mammites, arthrites
- dispar Pneumonies
- californicum, canadense Mammites
- alkalescens Arthrites
- bovigenitalium Troubles génitaux, mammites
- bovocculi Conjonctivites
49Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
- Mycoplasma OV, CP
- capricolum subsp capripneumoniae
Pleuropneumonie contagieuse (CP) - capricolum subsp capricolum Mammites, arthrites
(CP) - mycoides subsp capri Pneumonie, arthrites,
mammites (CP) - mycoides subsp mycoides LC
- ovipneumoniae Pneumonie (Agneau)
- conjonctivae Kératoconjonctivite infectieuse
(OV) - agalactiae Mammite, arthrites
50Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
- Mycoplasma PC
- hyopneumoniae Pneumonie enzootique
- hyorhinis Pneumonies, polysérosites
- hyosynoviae Arthrites
- haemosuis Anémie
- (ex-Eperythrozoon suis) (troubles de la
reproduction)
51Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
- Mycoplasma CN, CT, CV
- cynos (canis) Troubles respiratoires (CN)
- haemocanis Anémie (CN)
- (ex-Haemobartonella canis)
- felis Troubles respiratoires, conjonctivite
(CT) Pleurésie (CV) - haemofelis Anémie infectieuse féline
- (ex-Haemobartonella felis)
52Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
Mycoplasma Volaille
- gallisepticum Troubles respiratoires
(poulet) Sinusite, aérosacculite (dindon) - meleagridis Aérosacculite, sinusite, arthrites
(dindon) - synoviae Aérosacculite, arthrites,
ténosynovites - iowae Aérosacculite (légère)
- anseris Troubles respiratoires (oie)
53Les grands groupes bactériens GRAM
Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma
Mycoplasma Rongeurs
- arthritidis Arthrites (rat)
- pulmonis Troubles respiratoires et génitaux
(rats et souris) - Ureaplasma
- diversum BB Avortements, troubles
génitaux - Acholeplasma
- oculi Tous Conjonctivites
- equifetale CV Avortements (?)
- axanthum Oie Aérosacculite
54E coli Klebsiella Enterobacter
Salmonella Proteus Yersinia
55Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae Vibrionaceae Pseudomonaceae
Alcaligenaceae
A. Définition
coccobacilles bâtonnets droits
bâtonnets droits coccobacilles
ou incurvés à bacilles (0,3-1,0 x
1,0-6,0 mm) (0,5-1,0 x 1,5-3,5 mm)
(0,5-1,0 x 1,5-5,0 mm) (0,2-0,8 x 0,5-2,5 mm)
aéroanaérobies aéroanaérobies
aérobies strictes aérobies strictes
catalase
oxydase - oxydase (-) oxydase
(-) oxydase
mobilité /- ou (-)
spores -
métabolisme RF métabolisme RF
métabolisme R métabolisme R
test O/F F test O/F F test O/F O
test O/F -
56Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
B. Biologie
57Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
- coliformes Gassner lactose ( fermentation
du lactose) - Escherichia coli TOUS
- Klebsiella pneumoniae HO (animaux)
- Enterobacter sp. HO, CV (autres)
- autres Gassner lactose (pas de
fermentation du lactose) - Salmonella enterica TOUS
- Yersinia pseudotuberculosis rongeurs,
passereaux - Y. enterocolitica HO (animaux)
- Y. pestis
- Y. ruckeri poissons
- Edwardsiella tarda poissons, HO (autres)
- Ed. ictaluri poissons
- Proteus sp., Morganella sp. TOUS
- Serratia sp., Providencia sp.
- Shigella sp. HO, primates
58Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
Subdivisions en sérovars quelques exemples
- Escherichia coli sérovars OKHF
- O78K-H-F11 colibacillose de la volaille
- O101K30H-F5 diarrhée du veau nouveau-né
- O103K-H-F- colibacillose du lapereau
- O141K85H-F18 maladie de ldème du porcelet
- O157K-H7F- entérocolite hémorragique de
lhomme
- Salmonella enterica sérovars OH
- Typhimurium (O1,4,5,12H1,2) tous les
mammifères - Typhimurium variété Copenhagen (O1,4,12H1,2)
pigeon - Dublin (O6,8He,n,x) plutôt associé au bovin
- Hadar (O1,9,12H-) diverses espèces, dont le
cheval et la volaille - Choleraesuis (O6,7H1,5) plutôt associé au porc
59Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
N.B E. coli indicateur de contamination
fécale des aliments (cfr Enterococcus)
60Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Shigella dysenteriae, Sh. sonnei, Sh. flexneri
61Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Yersinia enterolitica (Y. pseudotuberculosis)
62Les grands groupes bactériens Gram-
Enterobacteriaceae
D. Altération des denrées alimentaires (goût,
couleur, odeur,)
- Proteus sp.
- Erwinia sp.
- Serratia sp.
- Providencia sp.
- Morganella sp.
63Les grands groupes bactériens Gram-
Vibrionaceae
B. Biologie
- eaux douces et marines, égouts, animaux marins
- pas de résistance particulière
- pathogènes obligés ou opportunistes
- diarrhées, infections généralisées
64Les grands groupes bactériens Gram-
Vibrionaceae
- Vibrio cholerae HO (diarrhée)
- V. salmonicida
- V. anguillarum Poissons (infections
généralisées) - V. ordalii
- V. metschnikovi Oiseaux, batraciens
- (infections généralisées)
- Aeromonas salmonicida
- Aer. caviae Poissons (infections
généralisées) - Aer. sobria
- Aer. hydrophila Poissons, oiseaux
(infections généralisées) - (mammifères diarrhée)
- Plesiomonas shigelloides PC, CN, CT (diarrhée)
65Les grands groupes bactériens Gram-
Vibrionaceae
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
66Les grands groupes bactériens Gram-
Pseudomonaceae
B. Biologie
- habitat milieu extérieur
- saprophytes, pathogènes opportunistes
-
- plaies, abcès, surinfections, infections
chroniques, morve - ! un pathogène obligé des solipèdes
Burkholderia mallei) ! - forte résistance dans le milieu extérieur
- (sauf Burkholderia mallei)
- résistance naturelle (constitutive) aux
antibiotiques - (surtout Pseudomonas
aeruginosa)
67Les grands groupes bactériens Gram-
Pseudomonaceae
68Les grands groupes bactériens Gram-
Pseudomonaceae
C. Altération des denrées alimentaires (goût,
couleur, odeur,)
- Pseudomonas spp
- Shewanella putrefasciens (ex-Pseudomonas
putrefasciens)
69Les grands groupes bactériens Gram-
Alcaligenaceae
B. Biologie
- eaux, sols peu pathogènes, opportunistes
- genre Alcaligenes (surinfecti
ons) - animaux pathogènes, peu résistantes
- genre Bordetella (troubles
respiratoires)
- Bordetella pertussis HO (coqueluche)
- B. parapertussis
- B. bronchiseptica Mammifères
- B. avium Oiseaux
- Alcaligenes sp. TOUS
70(No Transcript)
71Les grands groupes bactériens GRAM-
Pasteurellaceae
A. Définition
- coccobacilles à bâtonnets fins (0,2 - 0,3 x 0,3
- 2,0 µm) - ! pléiomorphisme !
- aéroanaérobies (microaérobies, anaérobies,
carbacidophiles) - catalase (- très rares)
- oxydase (quelques exceptions -)
- mobilité
- spores -
- métabolisme R et F (ou NA microaérobies,
anaérobies) - test O/F F
- ! certaines espèces exigence en facteurs V
et/ou X !
72Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
B. Biologie
- parasites des muqueuses respiratoires, digestives
et génitales des animaux (mammifères, oiseaux,
reptiles, poissons) ! toutes ! - pathogènes parfois primaires, souvent secondaires
- certaines espèces non pathogènes
- très sensibles aux agents physiques, chimiques et
biologiques (dont les pénicillines et macrolides)
73Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
Pasteurella
- P. multocida mammifères, oiseaux
- troubles respiratoires oreille
- P. canis, dogmatis, stomatis tous homme
- gueule des carnivores, infections des
plaies - P. canis biotype 2 veau
- P. caballi (catalase -) cheval
- P. gallinarum gallinacés
- troubles respiratoires
- P. avium, volanticum, spA pigeons
- non pathogènes
- exigence v en facteur V
- coccobacilles
- aéroanaérobies
- catalase (-)
- oxydase
- mobilité -
- métabolisme R et F
- test O/F F
74Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
- Mannheimia (ex-Pasteurella) (cf Pasteurella)
- M. haemolytica biotype A ruminants
(oiseaux) - pneumonies
- ( P. mastitidis mammites ruminants)
- M. haemolytica biotype T agneaux
- septicémies
- Pasteurella (cf Pasteurella)
- P. pneumotropica rongeurs
- troubles respiratoires
75Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
- Actinobacillus (cf Pasteurella)
76Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
Haemophilus exigence en facteurs V et/ou X
- très petits bâtonnets
- microaérobies, carbacidophiles
- catalase
- oxydase
- mobilité -
- métabolisme R et F
- test O/F NA
- croissance lente (2-4 jours)
- Haem. parasuis PC
- maladie de Glasser (polysérosite fibrineuse)
- Haem. paragallinarum volaille
- coryza infectieux
- Haem. haemoglobinophilus CN
- Haem. paracuniculis lapin, rongeurs
77Les grands groupes bactériens Gram-
Pasteurellaceae
Histophilus
- petits bâtonnets
- anaérobies, carbacidophiles
- catalase -
- oxydase -
- mobilité -
- métabolisme F
- test O/F NA
- croissance lente (2-4 jours)
- Hist. somni BB, OV
- Infections multiples
- respiratoires
- méningo-encéphalites
- avortements
- ! Regroupe les noms suivants !
- Haemophilus somnus
- Haemophiulus ovis
- Histophilus agni
78(No Transcript)
79Les grands groupes bactériens Gram-
A. Définition
80Les grands groupes bactériens Gram-
B. Biologie
- parasite des muqueuses génitales
- non pathogène pour létalon
- pathogène pour la jument
- peu résistant dans le milieu extérieur
- parasite des muqueuses buccales
- groupe DF-1 chez lhomme
- groupe DF-2 chez les carnivores
- peu résistant dans le milieu extérieur
C. canimorsus contamination de morsures,
abcès, septicémie homme, animaux C.
cynodegmi gingivite, stomatite carnivores
T. equigenitalis jument métrite
contagieuse équine (CEM)
81Les grands groupes bactériens Gram-
C. Altération des denrées alimentaires (goût,
couleur, odeur,)
- le genre Flavobacterium fait partie de la
famille des - Flavobacteriaceae au même titre que le genre
Capnocytophaga
82Les grands groupes bactériens Gram-
Groups EF4a Streptobacillus
Groupe EF4a
- cfr Pasteurella
- test O/F F
- ! Mais inactif sur les autres sucres !
- bouche des carnivores HO animaux
- infection de plaies par morsure
Streptobacillus moniliformis
- bâtonnets longs, filamenteux et perlés
- muqueuses respiratoire et buccale des rongeurs
- infections respiratoires rongeurs
- rat-bite fever HO
- Haverhill fever HO
- (contamination à partir de leau de boisson)
83(No Transcript)
84Les grands groupes bactériens Gram-
Bacteroidaceae
A. Définition
- coccobacilles, bâtonnets, filaments
- (1 x 1,0 à 10 µm filaments jusquà 100
mm) - anaérobies stricts
- catalase - ()
- oxydase -
- mobilité -
- spores -
- métabolisme fermentatif
- Test O/F non applicable
- renflements, vacuoles, formes en fuseaux
85Les grands groupes bactériens Gram-
Bacteroidaceae
B. Biologie
- nature sols, air
- cavités des animaux tractus digestif, génital
- surface des animaux peau, espace interdigité,
onglons - saprophytes, pathogènes opportunistes, pathogènes
obligés - résistants dans le milieu extérieur
- certaines espèces très résistantes aux
antibiotiques ! - certaines espèces sensibles aux b-lactames !
diarrhée, péritonite, abcès,
pododermatites (piétin)
86Les grands groupes bactériens Gram-
Bacteroidaceae
- Bacteroides fragilis entérites, péritonites,
abcès Tous - spp
- Dichelobacter nodosus
- piétin OV
- abcès, furoncles interdigités BB
- Fusobacterium necrophorum
- abcès, furoncle interdigité PC, BV, OV
- abcès disséminés ( nécrobacillose) Tous
- Fusobacterium nucleatum, russii CN, CT
- pathogénicité ?
87Les grands groupes bactériens Gram-
Anaerobiospirillum
Anaerobiospirillum succinoproducens
- gros bâtonnets spiralés
- anaérobies strictes
- tube digestif CN, CT
- diarrhée
88Francisella Neisseria Flavobacterium Tenacibaculum
Acinetobacter EF4b
Brucella Bartonella Moraxella Branhamella Riemerel
la Weeksella Legionella Afipia
89Les grands groupes bactériens Gram-
Francisella
Neisseria
A. Définition
diplocoques aplatis (en grains de café) (0,6
1,0 mm) catalase oxydase test O/F O
petits coccobacilles (0,2 x 0,2 - 1,7
µm) catalase (faible) oxydase - test O/F
O (lentement)
aérobies strictes
mobilité spores métabolisme R
90Les grands groupes bactériens Gram-
Neisseria
Francisella
B. Biologie
Genre Francisella
- parasites obligés rongeurs et lagomorphes
- très sensibles dans le milieu extérieur (sauf
eaux humidité) - pathogènes des animaux et de lhomme
- pathogènes intra-cellulaires facultatifs
Genre Neisseria
- commensaux des muqueuses de lhomme et des
animaux - pathogènes de lhomme
- non (ou peu) pathogènes chez lanimal
91Les grands groupes bactériens Gram-
Francisella
Neisseria
- Francisella tularensis
- tularémie septicémie avec granulomes
(pseudotubercules) -
- subsp tularensis biotype A lagomorphes hémis
phère Nord (Amérique) - subsp novicida ? rongeurs
- subsp paleartica biotype B rongeurs
- hémisphère Nord (Eurasie)
92Les grands groupes bactériens Gram-
Neisseria
Francisella
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Francisella tularensis (tularémie)
93Les grands groupes bactériens Gram-
Groupe EF4b
Acinetobacter
A. Définition
coques bâtonnets (en code morse) (1,0 - 1,5 x
1,5 - 2,5 µm) oxydase test O/F O (-)
Coccobacilles (cfr Pasteurella groupe
EF4a) oxydase test O/F O
aérobies strictes catalase mobilité
spores- métabolisme R
B. Biologie
- habitants des eaux, sols, muqueuses
- très peu pathogènes
- infections nosocomiales (HO)
- bouche des carnivores
- infections de plaies par morsure
- HO, animaux
94Les grands groupes bactériens Gram-
Acinetobacter
Groupe EF4b
C. Altération des denrées alimentaires (goût,
couleur, odeur,)
Genre Acinetobacter
Exemple Acinetobacter johnsonii flore des
aliments frais ou altérés (lait, produits
laitiers, carcasse de volailles, poissons) !
quelques souches capsulées (lévanes) aptes à
donner une consistance visqueuse au lait, à la
surface des fromages !
95Les grands groupes bactériens Gram-
Tenacibaculum
Flavobacterium
A. Définition
Bâtonnets (0,5 x 1,0-3,0 mm filaments jusquà
100 mm) aérobies strictes catalase oxydase
mobilité (par glissement) spores- métabolisme
R test O/F O
B. Biologie
- habitants des eaux et des sols
- beaucoup despèces peu pathogènes
- quelques espèces pathogènes
- infections nosocomiales (HO)
- certaines espèces psychrophiles
- habitant des eaux de mer et de lenvironnement
marin - conditions particulières de croissance
96Les grands groupes bactériens Gram-
Flavobacterium
Tenacibaculum
- Flavobacterium psychrophilum septicémie poissons
- (ex- Cytophaga psychrophila) lésions
cutanées deau froide - (ex- Flexibacter psychrophilus)
- Fl. columnare maladie des alevins truites
- (ex-Flexibacter columnaris)
- Fl. bronchiophilum
- Fl. lydatis maladie des branchies poissons
- (ex-Cytophaga aquatilis) lésions cutanées
- Fl. johnsoniae
- (ex-Cytophaga johnsonae)
- (ex-Flexibacter aurantiacus)
- Tenacibaculum maritimum maladie des
branchies poissons - (ex-Flexibacter maritimus) lésions
cutanées (eaux salées) - Ten. ovolyticum maladie des ufs et
alevins poissons (flétan)
97Francisella Neisseria Flavobacterium Tenacibaculum
Acinetobacter EF4b
Brucella Bartonella Moraxella Branhamella Riemerel
la Weeksella Legionella Afipia
98Les grands groupes bactériens Gram-
Brucella
Bartonella
A. Définition
coccobacilles bâtonnets droits ou
incurvés (0,5-0,7 x 0,5-1,5 µm) (0,3 - 0,5 x
1,0 - 1,7 µm) aérobies strictes
(carbacidophiles parfois en primo-culture)
catalase catalase - oxydase
v oxydase mobilité
mobilité v spores métabolisme R
test O/F - légèrement acido-résistants
(Koester) se colore mieux au Giemsa
99Les grands groupes bactériens Gram-
Brucella
Bartonella
B. Biologie
- parasites obligés du tractus génital
- dans la nature après avortement (par exemple)
- résistantes à la dessication, à la putréfaction
- sensibles aux antiseptiques et aux agents
physiques - pathogènes intra-cellulaires facultatifs
- pathologies avortements
- troubles génitaux
- bursites
- autres
- parasites du sang, des globules rouges et des
cellules endothéliales - hôtes intermédiaires puces, poux, mouches (?)
- transmission
- - par contact avec le sang
- - par griffures
- - par piqûres de larthropode
- pathologies anémies
- endocardite
- lymphadénite
- éruption verruqueuse
100Les grands groupes bactériens Gram-
Brucella
Bartonella
- ! différentes espèces ou 1 espèce avec différents
éco-biotypes ! - Br. melitensis (3 biotypes) OV, CP homme,
bovins, porcs - Br. abortus (7 biotypes) BB homme, chiens,
ovins, porcs, chevaux - Br. suis (5 biotypes) PC chevaux, homme,
chiens - Br. ovis béliers ?
- Br. canis CN ? (homme)
- Br. neotamae rongeurs -
- Br. cetaceae cétacés ?
- Br. pinnipedae pinnipèdes ?
101Les grands groupes bactériens Gram-
Brucella
Bartonella
- B. henselae maladie de la griffe du
chat HO puces - (abcès, lymphadénite, bactériémie,
endocardite, ) - B. clarridgeiae Idem HO puces
- B. bovis ? BB ?
- B. chomelii ? cervidés ?
- B. quintana fièvre des tranchées HO poux
- B. bacilliformis fièvre dOroya HO mouche
- (Amérique du Sud) (Phlebotomus)
102Les grands groupes bactériens Gram-
Brucella
Bartonella
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Brucella abortus, melitensis (suis)
103Les grands groupes bactériens Gram-
Moraxella, Branhamella, Riemerella, Weeksella
A. Définition
- coques (Branhamella) bâtonnets (Moraxella,
Riemerella, Weeksella) - (1,0 - 1,5 µm) (1,0 - 1,5 x 1,5 - 2,5 µm)
- aérobies strictes
- catalase
- oxydase
- mobilité
- spores
- métabolisme R
- test O/F -
104Les grands groupes bactériens Gram-
Moraxella, Branhamella, Riemerella, Weeksella
B. Biologie
- habitants des muqueuses
- peu pathogènes (! Exceptions !)
- résistants dans le milieu extérieur
105Les grands groupes bactériens Gram-
Legionella
Afipia
A. Définition
coccobacilles bâtonnets (0,3-0,7 x
2,0-3,0 µm) (0,5-1,0 x 1,5-3,0 mm) aérobies
strictes catalase (faible) oxydase
v- mobilité spores métabolisme R test
O/F -
106Les grands groupes bactériens Gram-
Legionella
Afipia
B. Biologie
Genre Legionella
- habitants du milieu extérieur
- notamment dans leau douce (lac, rivière,
fontaine, machine à glace,) - résistants dans le milieu extérieur
- non pathogène pour les individus en bonne santé
- importance très limitée en médecine vétérinaire
Genre Afipia
- peu connue
- habitant des eaux (?)
- endosymbiotes damibes (?)
- dans les coussinets plantaires du chat (
vecteur mécanique) - intracellulaires facultatives
107Les grands groupes bactériens Gram-
Legionella
Afipia
- Legionella pneumophila Maladie du
légionnaire HO - Legionella spp. (pneumonie et maladie
systémique)
- Afipia felis Maladie de la griffe du chat HO
- (plus rare que Bartonella henselae)
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
108Francisella Neisseria Flavobacterium Tenacibaculum
Acinetobacter EF4b
Brucella Bartonella Moraxella Branhamella Riemerel
la Weeksella Legionella Afipia
109Les grands groupes bactériens Gram-
A. Définition
- bâtonnets courbes virgules, S, spires,
mouette (0,2-0,5 x 0,5-5 µm) - microaérobies
- catalase ou -
- oxydase
- mobilité (tire-bouchon)
- spores
- métabolisme R
- test O/F NA
110Les grands groupes bactériens Gram-
B. Biologie
- parasites des muqueuses génitales, stomaccales
et intestinales - pathogènes obligés, pathogènes opportunistes ou
non pathogènes - très sensibles dans le milieu extérieur et aux
antiseptiques - quelques résistances à des antibiotiques
- polymyxinesR
- triméthoprimeR
- sulfamidésR
111Les grands groupes bactériens Gram-
Genre Campylobacter
- C. jejuni entérites Tous
- C. coli hépatite Oiseaux
- C. fetus subsp fetus avortements OV (BB)
- C. fetus subsp venerealis avortements BB
112Les grands groupes bactériens Gram-
Genre Helicobacter
113Les grands groupes bactériens Gram-
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
Genre Campylobacter
- Campylobacter coli, C. lari, C. upsaliensis
114Les grands groupes bactériens Gram-
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
Genre Helicobacter
Genre Arcobacter
115Les grands groupes bactériens Gram-
Spirillum
A. Définition
- Position taxonomique incertaine
- bâtonnets hélicoïdaux (0,2 x 3 - 5 µm)
- mise en culture non prouvée
- apparemment microaérobies
B. Biologie
- muqueuses buccale et respiratoire des rongeurs
- très sensibles dans le milieu extérieur
- pouvoir pathogène important
- Spirillum minor rat-bite fever HO
- sodoku
116(No Transcript)
117Les grands groupes bactériens Gram-
Famille Spirochetaceae
A. Définition
- bâtonnets spiralés fins et longs (0,1 - 0,5 x 3
- 20 µm) - (spires étroites, régulières, (idem)
(spires larges, régulières, - et peu séparées)
et bien séparées) - non cultivables anaérobies
strictes microaérobies - (ou non cultivables)
- Gram
- (peu colorable) (bien colorable) (peu
colorable) - (coloration de Giemsa) (coloration de
Giemsa) - catalase ? catalase - catalase -
- oxydase ? oxydase - oxydase -
- mobilité (cils aux deux extrémités sous la
membrane externe) - spores
- métabolisme ? métabolisme F métabolisme ?
- test O/F ? test O/F NA test O/F NA
118Les grands groupes bactériens Gram-
B. Biologie
- dans les cavités orales, intestinales et / ou
génitales - très sensibles dans le milieu extérieur
- pouvoir pathogène variable
- genre Borrelia cycle avec hôte intermédiaire
obligatoire - arthropodes piqueurs hématophages
- tiques des genres Ixodes, Rhipicephalus,
Boophilus, Argos
119Les grands groupes bactériens Gram-
- Treponema pallidum syphilis HO
- T. paraluiscuniculi syphilis lapin (
lésions cutanées et lymphadénites) - Brachyspira hyodysenteriae entérocolite et
dysenterie PC - Br. pilosicoli diarrhée CN, PC, HO
- Br. innocens non pathogène PC
- Borrelia burgdorferi maladie de Lyme
HO, mammifères - B. garinii ( fièvre, abattement, érythème,
polyarthrites,) - B. afzeli (avortements, néphrites, )
- (cultivables, microaérobies, régions
tempérées) - B. anserina syndrome dabattement oiseaux
- (non cultivable, régions tropicales)
- B. theileri peu pathogène ruminants
- (non cultivable, régions tropicales)
120Les grands groupes bactériens Gram-
Leptospira
Famille Leptospiraceae
A. Définition
- bâtonnets spiralés (0,1 x 6 - 12 µm) en S ou en C
- (avec des spires étroites et irrégulières)
- aérobies strictes
- Gram mais peu colorables (coloration de Giemsa)
- catalase
- oxydase
- mobilité (cils aux deux extrémités sous la
membrane externe) - spores
- métabolisme R
- test O/F croissance trop lente et difficile
121Les grands groupes bactériens Gram-
Leptospira
B. Biologie
- 2 groupes qui sont assimilés à deux espèces
- Leptospira biflexa
- non pathogènes
- résistantes dans le milieu extérieur
- L. interrogans
- pathogènes et parasites
- peu résistants dans le milieu extérieur
- habitat tubuli rénaux des espèces hôtes et
réservoirs - subdivision en sérovars avec une relative
spécificité dhôte et de réservoir
- L. interrogans leptospirose mammifères
- ( néphrite interstitielle, hépatite,
avortements, )
122Les grands groupes bactériens Gram-
Leptospira
Espèces domestiques hôtes principales
(secondaires)
- Pomona bétail, ovins, porcins, équins (canins,
félins, humains) - Canicola canins, félins, humains, (bovins,
porcins, équins) - Hardjo bovins, (ovins, humains, équins)
- Icterohaemorrhagiae canins, humains, (bovins,
porcins, équins) - Autumnalis (canins, humains)
- Grippotyphosa ovins, équins, (bovins, porcins,
canins, humains, félins) - Sejroe bovins
- Tarrasovi (porcins)
- Australis (bovins, canins, équins)
- Bataviae (humains, félins)
- Bratislava (porcins, équins)
123Les grands groupes bactériens Gram-
Leptospira
Réservoirs
- Pomona bétail, porcs, animaux sauvages
- Canicola chien et canidés sauvages, bétail,
porcs - Hardjo bétail, moutons
- Icterohaemorrhagiae rats, souris
- Autumnalis Grippotyphosa Sejroe faune sauvage
- Tarrasovi porc
- Australis hérisson
- Bataviae chien, rat, souris
- Bratislava bétail, porc, chevaux
124Les grands groupes bactériens Gram-
Leptospira
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
125Aegyptionella Anaplasma
Cowdria Coxiella Ehrlichia Neorickettsia Ricketts
ia
126Les grands groupes bactériens Gram-
Chlamydia
Chlamydophila
Famille Chlamydiaceae
Ordre des Chlamydiales
A. Définition
B. Biologie
- transmission directe par aérosol
- pas dhôte intermédiaire
- dépendant de la cellule hôte pour la production
dénergie - infecte de très nombreux types de cellules
127Les grands groupes bactériens Gram-
Chlamydophila
Chlamydia
- Chlamydia trachomatis trachome, urogénital,
pneumonie HO - Chlamydia suis non pathogène PC
- Chlamydia muridarum ? souris
- Chlamydophila pneumoniae pneumonies HO
- Chlamydophila psittaci psittacose -
ornithose oiseaux (HO) - Chlamydophila felis conjonctivites,
pneumonies chats - Chlamydophila pecorum polyarthrites,
pneumonies, ruminants - conjonctivites
- Chlamydophila abortus avortements, OV (BB,
HO) infections génitales
128Aegyptionella Anaplasma
Cowdria Coxiella Ehrlichia Neorickettsia Ricketts
ia
129Les grands groupes bactériens Gram-
Ordre des Rickettsiales
Famille Anaplasmataceae
A. Définition
- corps élémentaire forme infectant lhôte
intermédiaire - (0,3 1,0 mm)
- corps réticulé forme intracellulaire libre
- bactéries pourvues dun PDG
- peu colorable au Gram, colorable au Giemsa
- entrée dans la cellule division(s) deux ou quatre
bactéries
B. Biologie
- transmission par arthropodes piqueurs
hématophages (tiques) - lhôte intermédiaire est larthropode
- dépendant de la cellule hôte certaines parties du
métabolisme - infecte les érythrocytes
130Les grands groupes bactériens Gram-
- Anaplasma marginale anémie, BB arthropodes
- ictère (tiques)
- Anaplasma centrale non pathogène BB idem
- Anaplasma ovis peu pathogène OV idem
- (anémie)
- Aegyptionella pullorum anémie, oiseaux tiques
- leucopénie (Argas persicus)
- Haemobartonella felis voir Mycoplasma
haemofelis - Haemobartonella canis voir Mycoplasma haemocanis
- Eperythrozoon suis voir Mycoplasma haemosuis
131Aegyptionella Anaplasma
Cowdria Coxiella Ehrlichia Neorickettsia Ricketts
ia
132Les grands groupes bactériens Gram-
Ordre des Rickettsiales
Famille Rickettsiaceae
A. Définition
- corps élémentaire forme infectant lhôte
intermédiaire ou forme libre (genre
Coxiella) (0,3 1,0 mm) - corps réticulé forme intracellulaire à
lintérieur dune vésicule/vacuole - bactéries pourvues dun PDG
- peu colorable au Gram, colorable au Giemsa
- entrée dans la cellule divisions morula
133Les grands groupes bactériens Gram-
B. Biologie
- transmission par arthropodes piqueurs
hématophages (tiques) - ! Biologiquement, le mammifère est souvent un
hôte accidentel terminal ! - le genre Coxiella ne présente pas dhôte
intermédiaire obligé et se transmet fréquemment
par aérosol - le genre Neorickettsia présente un cycle à trois
hôtes un parasite (douve du foie du saumon), le
saumon et le canidé - dépendant de la cellule hôte certaines parties du
métabolisme - infecte les cellules endothéliales (genres
Cowdria et Rickettsia), les macrophages et
cellules du système réticulo-endothélial (genres
Coxiella et Neorickettsia) et/ou les leucocytes
(genre Ehrlichia)
134Les grands groupes bactériens Gram-
- Cowdria ruminantium oedèmes, péricardite ruminants
tiques - ( Heart water ) (Amblyomma)
- Coxiella burnetii avortements BB (CT)
souvent tiques - syndrome grippal HO pas dhôte
- ( Fièvre Q )
intermédiaire
- Ehrlichia canis leucopénie, CN tiques
- thrombocytopénie (Rhipicephalus sanguineus)
- E. risticii leucopénie, CV ? (tiques)
- diarrhée ( Potomac horse fever )
- E. phagocytophilia leucopénie OV (BB) tiques
- (ex-Cytoecetes) ( Tick-borne fever )
(Ixodes ricinus) - E. equi leucopénie, vasculite CV ? (tiques)
- Neorickettsia syndrome général CN Douve
du foie - helminthoeca ( Salmon poisoning ) du
saumon - Rickettsia rickettsii vasculite HO (CN,
OV) tiques - hémorragies, thromboses (Dermatocentor spp.)
- ( Rocky Mountain spotted fever )
135Les grands groupes bactériens Gram-
C. Importance au niveau des denrées alimentaires
(pour lhomme)
- Coxiella burnetii (fièvre Q)
136Aegyptionella Anaplasma
Cowdria Coxiella Ehrlichia Neorickettsia Ricketts
ia
137Les grands groupes bactériens Gram-
Lawsonia
A. Définition
B. Biologie
- petits bâtonnets incurvés
- (0,2-0,5 x 0,5-1,5 mm)
- forme de campylobactère
- intracellulaire obligé
- symbiote des entérocytes
Complexe adénomatose proliférative PC -
adénomatose bénigne - entérite nécrotique -
iléite régionale - entéropathie hémorragique