Dynamique de la fitness moyenne dans les interactions hteparasite

1
Journée écologie numérique Epidémiologie
évolutive comment prendre en compte la
stochasticité? Sylvain GANDON CEFE
2
Plan

• 1. Modèles déterministes
• - Epidémiologie
• - Evolution
• 2. Modèles stochastiques
• - Epidémiologie
• - Evolution

3
Epidémiologie
Ecologie et démographie des maladies infectieuses
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
4
Epidémiologie
Ecologie et démographie des maladies infectieuses
Dans une population à léquilibre sans parasites
(SS0)
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
5
Epidémiologie
La vaccination
Eradication
Couverture de vaccination, p
Variole
avant vaccination
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
6
Dynamique adaptative
Est-ce que le mutant peut envahir?
g
Infectés I
? ?
?
Sains S
?
?
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
7
Epidémiologie évolutive
Epidémiologie
Evolution des fréquences
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
8
Epidémiologie évolutive
Epidémiologie
Evolution des phénotypes,
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
9
Dynamique de ladaptation
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
10
Dynamique de ladaptation
Changement de lenvironnement
Mutation
Sélection
Stochasticité?
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
11
Epidémiologie stochastique
Pour quoi faire? - probabilité démergence de
maladies - probabilité dextinction et temps
dextinction
Quelle stochasticité? - échantillonnage -
environnementale - démographique
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
12
Epidémiologie stochastique
Gillespie (1991), Lande (2009)
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
13
Epidémiologie stochastique
Gillespie (1991), Lande (2009)
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
14
Epidémiologie évolutive stochastique
Pour quoi faire? - impact de la dérive génétique
sur ladaptation - adaptation ou extinction? -
évolution de stratégies robustes (bet hedging)?
Quelle stochasticité? - environnementale -
démographique
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
15
Epidémiologie évolutive stochastique
Lande (2007, 2009)
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.
16
Epidémiologie évolutive stochastique
Lande (2009)
Frank Slatkin (1990)
Variance in genotypic r corr in r Variance
individual r
Gillespie(1974)
Dempster(1955)
Epidémiologie
Evolution
Adaptation
Perspectives
Epidémiologie
Epid. Evolution
Stoc. Epid.
Stoc. Epid. Evol.