Fundamentos de Biologa Aplicada I

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Módulo de GenéticaBioinformática
Profesores José L. Oliver Angel Martín
Alganza Inmaculada Manrique Poyatos
2
De nada a todo
Biología Molecular un gen una proteína un
gen un laboratorio un gen una tesis
Genómica un genoma una tesis
Antes se estudiaba el efecto de un
gen ignorando así al 99.99 restante Ahora
tenemos datos de todos los genes Qué hacer con
ellos? Cómo derivar nuevo conocimiento? ? Es
necesario un nuevo enfoque, un cambio de paradigma
2001
If you cant do Bioinformatics, you cant do
Biology J.D. Tisdall, Beginning Perl for
Bioinformatics, 2003
3
Un laboratorio de Biología?
4
Un laboratorio de Biología
5
El biólogo en la jungla de datos
Secuenciación
Genómica
Biología estructural
Biología Molecular
Medicina
Fisiología
Genética
Expresión génica
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Qué es la Bioinformática?

• Secuencias de genes y proteínas
• Estructuras 3D
• Expresión génica (microarrays)
• Interacción entre proteínas (interactoma)

Biología Molecular Genómica
Conocimiento biológico
Bases de datos Programas
Salud Biotecnología Medio ambiente Genómica
comparada Evolución
Computación Algorítmica
7
usuarios
desarrolladores
8
Sesión A

• Bases de datos de ADN y proteínas
• Búsqueda y recuperación de secuencias
• Mediante palabras clave
• Por homología de secuencia
• Análisis básico de secuencias de ADN y proteínas
• Complementaria inversa de una secuencia
• Composición de nucleótidos
• Contenido en GC
• Mapas de restricción

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Sesión B

• Comparación de dos secuencias
• Alineamiento múltiple de secuencias Filogenias
  moleculares
• Genómica funcional
• Búsqueda de ORFs en una secuencia
• Predicción computacional de genes
• Predicción de islas CpG

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Seminarios

• Exposición ORAL de un trabajo sobre
• Elaboración de la filogenia de un grupo de
  interés basándose en genes homólogos
• o bien
• Anotación exhaustiva (genes, exones, intrones,
  promotores, islas CpG, etc.) de un fragmento de
  secuencia genómica anónima
• Las secuencias de partida para estos trabajos las
  proporcionará el profesor
• La calificación obtenida constituirá el 30 de la
  calificación final en el Módulo de Genética

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Evaluación

• El sistema de evaluación constará de 3 partes
• Evaluación continua durante las sesiones
  presenciales
• Exposición ORAL de alguno de los trabajos
  propuestos
• Examen final

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Tutoría electrónica
Jose L. Oliver oliver.tutorias_at_spambob.net Ang
el Martín Alganza ama_at_ugr.es Inmaculada
Manrique mpoyato_at_ugr.es
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Comencemos

• Encendamos el ordenador

• Usuario gen (Etiqueta adherida al monitor)
• Contraseña genetica (Todas las letras en
  minúscula y sin tilde)

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http//bioinfo2.ugr.es/FBA_bioinfo/