Auvergrid, une grille rgionale en Auvergne

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Auvergrid, une grille régionale en Auvergne

• V. Breton
• LPC Clermont-Ferrand

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Le concept de grille analogie
Le réseau électrique réseau haute tension
centrales de production délectricité
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Le concept de grille informatique (GRID)
Internet mise à disposition statique de
linformation Grilles internet ressources
informatiques services de gestion dynamique
de linformation (collecte, transfert, tri,
analyse)
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Auvergrid grille régionale pour lAuvergne

• Un partage de ressources
• Puissance de calcul (de lordre de 800 CPUs)
• Espace de stockage (de lordre de 50Toctets)
• Sauvegarde
• Un partage de compétences (8 établissements, 18
  laboratoires)
• Aide dans les choix technologiques
• Transfert de compétence systèmes et réseaux
• Un environnement pour collaborer
• Entre établissements partageant des thèmes de
  recherche
• Sur des projets pluridisciplinaires, en
  particulier dans les sciences du vivant
• Budget de 5 Millions deuros sur trois ans
  (2004-2006) dont 1,5 Millions deuros du Conseil
  Régional dAuvergne

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Les ressources informatiques dAuvergrid
En grille En fonctionnement isolé En cours
dinstallation En attente dinstallation
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La recherche avec Auvergrid

• Développements algorithmiques
• Calculs de structure (UBP)
• Radiosité discrète (UA)
• Parallélisation de simulations Monte-Carlo (UBP)
• Applications scientifiques
• Sciences du vivant (UA, UBP)
• Physique médicale (UBP, CJP)
• Physique des particules (UBP)
• Environnement (CEMAGREF)
• Chimie (UBP)
• 4 thèses et 3 séjours post-doctoraux en cours

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100 ans de calculs contre la grippe aviaire en un
mois

• Objectifs
• étudier limpact de mutations de la neuraminidase
  N1 sur lefficacité des médicaments actuels
  (Tamiflu)
• Identifier de nouveaux médicaments
• Méthode
• Calculs sur ordinateur des probabilités
  daccrochage des molécules sur la neuraminidase
  mutée
• Collaboration internationale
• Academica Sinica Taïwan
• ITB-CNR Italie
• LPC Clermont-Ferrand

N1
H5
Credit Y-T Wu
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Limpact de lAuvergne

• Identification de lobjectif scientifique
• Préparation du déploiement à grande échelle
• Coordination du déploiement sur 3 grilles
  Auvergrid, EGEE, TWGrid (taïwan)

Calculs effectués sur Auvergrid pour la grippe
aviaire en 2006
Phase de calculs
Phase de préparation
Credit J. Salzemann, E. Medernach, M. Reichstadt
Répartition mondiale des ressources mobilisées
pour un total de 100 années CPU
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Auvergrid, perspectives

• Mise en grille de 4 sites supplémentaires cette
  année
• IUT Aurillac, Biopôle, IUT Le Puy, IUT Montluçon
• Fin officielle du projet Décembre 2006
• Poursuite des thèses et des contrats dingénieurs
  jusquà lautomne 2007
• Mise en grille de 3 nouveaux sites en 2007
• Poursuite du projet Contrat de Projet Etat-Région

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Auvergrid, au coeur dune dynamique européenne
Embrace (2005-2009) Intégration des données
biologiques et des Outils danalyse sur
grille Réseau dexcellence FP6 European
Bioinformatics Institute (International)
EGEE-II (2006-2008) Infrastructure de grille
européenne Infrastructure FP6 CERN
(international)
Auvergrid
3 ingénieurs 1 thésard
2 ingénieurs
BioinfoGRID (2006-2007) Recherche de nouveaux
médicaments sur grille Action Spécifique FP6 CNR
(Italie)
SHARE (20062007) Grilles pour la santé Action
spécifique FP6 Healthgrid (Clermont-Ferrand)
1 thésard
1 ingénieur
5 ingénieurs et 2 thésards financés en Auvergne
sur les projets européens de grille du 6ème PCRD
ACGT (2005-2009) Intégration de données
biologiques et médicales pour la recherche sur
le cancer Projet intégré FP6
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Auvergrid et Lifegrid

• Partage dune infrastructure
• Ressources de stockage au CIRI et au LPC
• Ressources de calculs
• Partage de services
• Mise à jour et réplication de bases de données
  biologiques
• Portail bioinformatique (BLAST)
• Partage de ressources humaines et de compétences
• Ingénieurs mis à disposition pour léquipe
  technique Lifegrid
• Expertise sur les technologies de grilles et
  lintégration de données biologiques
• Partage dun réseau international de
  collaborateurs

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Conclusion

• Auvergrid, un outil unique pour le développement
  de la région Auvergne
• Une infrastructure pour la recherche
• Une expertise en plein développement
• Région Auvergne 2 ingénieurs, 4 thésards et 3
  post-doctorants
• 6ème PCRD 7 ingénieurs et 2 thésards
• Auvergrid a permis la reconnaissance
  internationale du rôle moteur de lAuvergne dans
  lutilisation des grilles pour les sciences du
  vivant et la santé
• Recherche de nouveaux médicaments contre la
  malaria et la grippe aviaire
• Auvergrid va continuer au-delà de 2006
• Infrastructure du projet Lifegrid
• Au-delà Contrat de Projet Etat Région